{"title":"生体分子の分子動力学シミュレーション (2) 応用","authors":"勇人 古明地, 澄恵 田島, 誠 原口, 伸幸 高橋, 正巳 上林, 雲兵 長嶋","doi":"10.2477/JCHEMSOFT.7.1","DOIUrl":null,"url":null,"abstract":"分子動力学シミュレーションは、生体高分子の構造・物性・機能相関の研究に有用であることが一般に認められている。本総説では、筆者らが開発した生体分子解析用ソフトウェアPEACH(Program for Energetic Analysis of bioChemical molecules)を使って、タンパク質とDNAの分子動力学シミュレーションを行う場合の手続きを、実践的に解説する。","PeriodicalId":205210,"journal":{"name":"Journal of Chemical Software","volume":"7 1","pages":"0"},"PeriodicalIF":0.0000,"publicationDate":"2001-03-01","publicationTypes":"Journal Article","fieldsOfStudy":null,"isOpenAccess":false,"openAccessPdf":"","citationCount":"1","resultStr":null,"platform":"Semanticscholar","paperid":null,"PeriodicalName":"Journal of Chemical Software","FirstCategoryId":"1085","ListUrlMain":"https://doi.org/10.2477/JCHEMSOFT.7.1","RegionNum":0,"RegionCategory":null,"ArticlePicture":[],"TitleCN":null,"AbstractTextCN":null,"PMCID":null,"EPubDate":"","PubModel":"","JCR":"","JCRName":"","Score":null,"Total":0}
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Abstract
分子動力学シミュレーションは、生体高分子の構造・物性・機能相関の研究に有用であることが一般に認められている。本総説では、筆者らが開発した生体分子解析用ソフトウェアPEACH(Program for Energetic Analysis of bioChemical molecules)を使って、タンパク質とDNAの分子動力学シミュレーションを行う場合の手続きを、実践的に解説する。
分子动力学模拟在研究生物大分子的结构、物性、功能相关方面具有广泛的应用价值。在本总说中,笔者开发的生物分子分析用软件PEACH (Program for Energetic Analysis of bioChemical使用molecules),对蛋白质和DNA的分子动力学进行模拟时的步骤进行实践性解说。