Detección molecular de virus en cultivos de uchuva (Physalis peruviana) del suroeste de Antioquia (Colombia)

Erika Corrales-Cabra, Mónica Higuita, Andrea Restrepo, Yuliana Gallo, Pablo Gutiérrez, Mauricio Alejandro Marín Montoya
{"title":"Detección molecular de virus en cultivos de uchuva (Physalis peruviana) del suroeste de Antioquia (Colombia)","authors":"Erika Corrales-Cabra, Mónica Higuita, Andrea Restrepo, Yuliana Gallo, Pablo Gutiérrez, Mauricio Alejandro Marín Montoya","doi":"10.15446/acag.v71n1.99453","DOIUrl":null,"url":null,"abstract":"La uchuva es una de las frutas promisorias para la zona andina de Colombia gracias a su alta demanda internacional. En Antioquia, su siembra se concentra en el oriente, aunque otras subregiones como el norte y suroeste presentan condiciones óptimas para su cultivo. Ya que las enfermedades de origen viral son uno de los problemas emergentes de este frutal, en este estudio se evaluó la infección de virus de RNA que infectan los cultivos de uchuva en el suroeste de Antioquia. Para esto se utilizaron pruebas de RT-qPCR en muestras foliares de plantas sintomáticas y asintomáticas obtenidas en ocho lotes, así como en ocho muestras de semillas extraídas de frutos comercializados en esta subregión. Los resultados indicaron la presencia en al menos una muestra foliar de los virus PVY, PVX, PVS, CGIV-1 y PMTV, mientras que PVV, PYVV y PhyVNV no fueron detectados. El PMTV (75 %) y el PVX (62.5 %) fueron los virus que presentaron mayores niveles de prevalencia en muestras sintomáticas y asintomáticas, respectivamente. Para el caso de las semillas, se encontró la infección de los virus PVX (87.5 %), PVS (75 %), PVY (37.5 %), PhyVNV (12.5 %) y CGIV-1 (12.5 %). Adicionalmente, mediante análisis de NGS se detectó la presencia de secuencias de los virus CMV, PhyVNV, PVS, y TaLMV. Estos hallazgos señalan la necesidad de establecer en el país programas de monitoreo de virus en cultivos de uchuva y de certificación de semilla.","PeriodicalId":476429,"journal":{"name":"Acta Agronómica","volume":"7 1","pages":"0"},"PeriodicalIF":0.0000,"publicationDate":"2023-01-15","publicationTypes":"Journal Article","fieldsOfStudy":null,"isOpenAccess":false,"openAccessPdf":"","citationCount":"0","resultStr":null,"platform":"Semanticscholar","paperid":null,"PeriodicalName":"Acta Agronómica","FirstCategoryId":"1085","ListUrlMain":"https://doi.org/10.15446/acag.v71n1.99453","RegionNum":0,"RegionCategory":null,"ArticlePicture":[],"TitleCN":null,"AbstractTextCN":null,"PMCID":null,"EPubDate":"","PubModel":"","JCR":"","JCRName":"","Score":null,"Total":0}
引用次数: 0

Abstract

La uchuva es una de las frutas promisorias para la zona andina de Colombia gracias a su alta demanda internacional. En Antioquia, su siembra se concentra en el oriente, aunque otras subregiones como el norte y suroeste presentan condiciones óptimas para su cultivo. Ya que las enfermedades de origen viral son uno de los problemas emergentes de este frutal, en este estudio se evaluó la infección de virus de RNA que infectan los cultivos de uchuva en el suroeste de Antioquia. Para esto se utilizaron pruebas de RT-qPCR en muestras foliares de plantas sintomáticas y asintomáticas obtenidas en ocho lotes, así como en ocho muestras de semillas extraídas de frutos comercializados en esta subregión. Los resultados indicaron la presencia en al menos una muestra foliar de los virus PVY, PVX, PVS, CGIV-1 y PMTV, mientras que PVV, PYVV y PhyVNV no fueron detectados. El PMTV (75 %) y el PVX (62.5 %) fueron los virus que presentaron mayores niveles de prevalencia en muestras sintomáticas y asintomáticas, respectivamente. Para el caso de las semillas, se encontró la infección de los virus PVX (87.5 %), PVS (75 %), PVY (37.5 %), PhyVNV (12.5 %) y CGIV-1 (12.5 %). Adicionalmente, mediante análisis de NGS se detectó la presencia de secuencias de los virus CMV, PhyVNV, PVS, y TaLMV. Estos hallazgos señalan la necesidad de establecer en el país programas de monitoreo de virus en cultivos de uchuva y de certificación de semilla.
查看原文
分享 分享
微信好友 朋友圈 QQ好友 复制链接
本刊更多论文
安蒂奥基亚西南部(哥伦比亚)uchuva (Physalis peruviana)培养物病毒的分子检测
由于国际需求旺盛,uchuva是哥伦比亚安第斯地区最有前途的水果之一。在安蒂奥基亚,种植集中在东部,尽管其他次区域,如北部和西南部,有最佳的种植条件。由于病毒性疾病是这种水果出现的问题之一,本研究评估了感染安蒂奥基亚西南部uchuva作物的RNA病毒感染。本研究的目的是评估在巴西南部parana州sao paulo市的一项研究中,对该地区8个批次的有症状和无症状植物的叶片样本以及8个从该次区域销售的水果中提取的种子样本进行RT-qPCR检测。结果表明,至少1个叶片样品中存在PVY、PVX、PVS、CGIV-1和PMTV病毒,而PVV、PYVV和PhyVNV未检测到。在有症状和无症状样本中,PMTV病毒(75%)和PVX病毒(62.5%)的患病率分别较高。种子感染PVX病毒(87.5%)、PVS病毒(75%)、PVY病毒(37.5%)、PhyVNV病毒(12.5%)和CGIV-1病毒(12.5%)。此外,通过NGS分析,检测巨细胞病毒、PhyVNV、PVS和TaLMV的序列。这些发现表明,有必要在该国建立uchuva作物的病毒监测和种子认证项目。
本文章由计算机程序翻译,如有差异,请以英文原文为准。
求助全文
约1分钟内获得全文 去求助
来源期刊
自引率
0.00%
发文量
0
期刊最新文献
Calidad e inocuidad de los alimentos en redes alimentarias alternativas, estudio de casos en Medellín, Colombia. Influencia del abono verde en los atributos físicos de un Latosol Amarillo distrófico Formulación de fertilidad online para cultivos tropicales con base en análisis físico-químico del suelo Recubrimiento a base de almidón de plátano (Musa ABB) para la protección del plátano de exportación Análisis de estabilidad de biochar de residuos agroforestales
×
引用
GB/T 7714-2015
复制
MLA
复制
APA
复制
导出至
BibTeX EndNote RefMan NoteFirst NoteExpress
×
×
提示
您的信息不完整,为了账户安全,请先补充。
现在去补充
×
提示
您因"违规操作"
具体请查看互助需知
我知道了
×
提示
现在去查看 取消
×
提示
确定
0
微信
客服QQ
Book学术公众号 扫码关注我们
反馈
×
意见反馈
请填写您的意见或建议
请填写您的手机或邮箱
已复制链接
已复制链接
快去分享给好友吧!
我知道了
×
扫码分享
扫码分享
Book学术官方微信
Book学术文献互助
Book学术文献互助群
群 号:481959085
Book学术
文献互助 智能选刊 最新文献 互助须知 联系我们:info@booksci.cn
Book学术提供免费学术资源搜索服务,方便国内外学者检索中英文文献。致力于提供最便捷和优质的服务体验。
Copyright © 2023 Book学术 All rights reserved.
ghs 京公网安备 11010802042870号 京ICP备2023020795号-1