灰葡萄孢不同寄主群体结构的分子指纹图谱

Derim Pub Date : 2018-12-03 DOI:10.16882/DERIM.2018.410051
İ. Polat, G. Sülü, A. Ki̇tapci, E. Gümrükcü, Ö. Baysal
{"title":"灰葡萄孢不同寄主群体结构的分子指纹图谱","authors":"İ. Polat, G. Sülü, A. Ki̇tapci, E. Gümrükcü, Ö. Baysal","doi":"10.16882/DERIM.2018.410051","DOIUrl":null,"url":null,"abstract":"Botrytis cinerea (teleomorph: Botryotinia fuckeliana ) ortualti sebze yetistiriciliginde kursuni kuf hastaligi etmenidir. Patojende olusan farkliliklarin bilinmesi hastalikla mucadelenin etkinligini arttirmaktadir. Calismada, Turkiye’nin Antalya ilinde yer alan 36 farkli seradan 42 adet izolat kullanilmistir. On iki SRAP (sequence-related amplified polymorphism) primer kombinasyonu ve 18 ISSR (inter simple sequence repeat) primeri dereotu, feslegen, marul, fasulye, hiyar, domates, biber ve patlicandan elde edilen B. cinerea izolatlarinin genetik farkliliklarinin belirlenmesinde oldukca yuksek polimorfizm saglamislardir. ISSR ve SRAP markirlardan elde edilen sonuclar UPGMA (The unweighted pair-group method with arithmetic average analysis) analizine gore izolatlar arasinda 0.15-0.90 oraninda degisen benzerlik elde edilmistir. Ayrica, cophenetic correlation degeri r=0.93 ile oldukca yuksek bulunmustur. Cluster analizi sonuclari degerlendirildiginde marul izolatlari diger izolatlara gore oldukca uzak kumelenmistir. Ayrica, tum izolatlar icin tranpozabl elementler ( Flipper ve Boty ) arastirilmis ve sadece Flipper element tespit edilmistir. Elde edilen genetik karakterizasyon sonuclarina gore, B. cinerea populasyonunda oldukca yuksek seviyede genetik farkliliklar bulunmustur. Bu durum, B. cinerea’ nin evrimsellesme potensiyeli ve gen akislarindan kaynaklanabilir. Farkli konukculardan elde edilen bu patojenin genetik farkliliklarinin belirlenmesinde kullanilan molekuler markirlar, ileride yapilacak calismalara da isik tutmaktadir.","PeriodicalId":30721,"journal":{"name":"Derim","volume":" ","pages":""},"PeriodicalIF":0.0000,"publicationDate":"2018-12-03","publicationTypes":"Journal Article","fieldsOfStudy":null,"isOpenAccess":false,"openAccessPdf":"","citationCount":"1","resultStr":"{\"title\":\"Molecular fingerprinting of Botrytis cinerea population structure from different hosts\",\"authors\":\"İ. Polat, G. Sülü, A. Ki̇tapci, E. Gümrükcü, Ö. Baysal\",\"doi\":\"10.16882/DERIM.2018.410051\",\"DOIUrl\":null,\"url\":null,\"abstract\":\"Botrytis cinerea (teleomorph: Botryotinia fuckeliana ) ortualti sebze yetistiriciliginde kursuni kuf hastaligi etmenidir. Patojende olusan farkliliklarin bilinmesi hastalikla mucadelenin etkinligini arttirmaktadir. Calismada, Turkiye’nin Antalya ilinde yer alan 36 farkli seradan 42 adet izolat kullanilmistir. On iki SRAP (sequence-related amplified polymorphism) primer kombinasyonu ve 18 ISSR (inter simple sequence repeat) primeri dereotu, feslegen, marul, fasulye, hiyar, domates, biber ve patlicandan elde edilen B. cinerea izolatlarinin genetik farkliliklarinin belirlenmesinde oldukca yuksek polimorfizm saglamislardir. ISSR ve SRAP markirlardan elde edilen sonuclar UPGMA (The unweighted pair-group method with arithmetic average analysis) analizine gore izolatlar arasinda 0.15-0.90 oraninda degisen benzerlik elde edilmistir. Ayrica, cophenetic correlation degeri r=0.93 ile oldukca yuksek bulunmustur. Cluster analizi sonuclari degerlendirildiginde marul izolatlari diger izolatlara gore oldukca uzak kumelenmistir. Ayrica, tum izolatlar icin tranpozabl elementler ( Flipper ve Boty ) arastirilmis ve sadece Flipper element tespit edilmistir. Elde edilen genetik karakterizasyon sonuclarina gore, B. cinerea populasyonunda oldukca yuksek seviyede genetik farkliliklar bulunmustur. Bu durum, B. cinerea’ nin evrimsellesme potensiyeli ve gen akislarindan kaynaklanabilir. Farkli konukculardan elde edilen bu patojenin genetik farkliliklarinin belirlenmesinde kullanilan molekuler markirlar, ileride yapilacak calismalara da isik tutmaktadir.\",\"PeriodicalId\":30721,\"journal\":{\"name\":\"Derim\",\"volume\":\" \",\"pages\":\"\"},\"PeriodicalIF\":0.0000,\"publicationDate\":\"2018-12-03\",\"publicationTypes\":\"Journal Article\",\"fieldsOfStudy\":null,\"isOpenAccess\":false,\"openAccessPdf\":\"\",\"citationCount\":\"1\",\"resultStr\":null,\"platform\":\"Semanticscholar\",\"paperid\":null,\"PeriodicalName\":\"Derim\",\"FirstCategoryId\":\"1085\",\"ListUrlMain\":\"https://doi.org/10.16882/DERIM.2018.410051\",\"RegionNum\":0,\"RegionCategory\":null,\"ArticlePicture\":[],\"TitleCN\":null,\"AbstractTextCN\":null,\"PMCID\":null,\"EPubDate\":\"\",\"PubModel\":\"\",\"JCR\":\"\",\"JCRName\":\"\",\"Score\":null,\"Total\":0}","platform":"Semanticscholar","paperid":null,"PeriodicalName":"Derim","FirstCategoryId":"1085","ListUrlMain":"https://doi.org/10.16882/DERIM.2018.410051","RegionNum":0,"RegionCategory":null,"ArticlePicture":[],"TitleCN":null,"AbstractTextCN":null,"PMCID":null,"EPubDate":"","PubModel":"","JCR":"","JCRName":"","Score":null,"Total":0}
引用次数: 1

摘要

fuckeliana(硬骨异形体:Botryotinia fuckeliiana)是植物叶性的一种正交紊乱。对病原体差异的了解增加了疾病对粘液的影响。在Calismada,使用了来自安塔利亚36个不同地点的42个分离株。两个SRAP(序列相关扩增多态性)和18个ISSR(简单序列间重复)引物费斯勒根、大理石、法苏利、hiyar、domates、biber和patlica的第一个组合导致灰葡萄球菌分离株具有相对较高的多态性。ISSR和SRAP标记的算术平均分析的未加权配对组方法与分离株之间0.15-0.90%的方法相似。此外,同源相关降解相对较高,r=0.93。聚类分析结果表明,这是一个很好的结果。此外,已检测到用于伪隔离器的可移动元件(Flipper和Boty),并且仅检测到Flipper元件。根据遗传特征鉴定结果,金耳种群存在较高的遗传差异。在这种情况下,灰葡萄球菌可以从进化潜力和基因酸中获得。用于确定来自不同客人的这种病原体的遗传差异的分子是标记,这使得calism有待进一步研究。
本文章由计算机程序翻译,如有差异,请以英文原文为准。
查看原文
分享 分享
微信好友 朋友圈 QQ好友 复制链接
本刊更多论文
Molecular fingerprinting of Botrytis cinerea population structure from different hosts
Botrytis cinerea (teleomorph: Botryotinia fuckeliana ) ortualti sebze yetistiriciliginde kursuni kuf hastaligi etmenidir. Patojende olusan farkliliklarin bilinmesi hastalikla mucadelenin etkinligini arttirmaktadir. Calismada, Turkiye’nin Antalya ilinde yer alan 36 farkli seradan 42 adet izolat kullanilmistir. On iki SRAP (sequence-related amplified polymorphism) primer kombinasyonu ve 18 ISSR (inter simple sequence repeat) primeri dereotu, feslegen, marul, fasulye, hiyar, domates, biber ve patlicandan elde edilen B. cinerea izolatlarinin genetik farkliliklarinin belirlenmesinde oldukca yuksek polimorfizm saglamislardir. ISSR ve SRAP markirlardan elde edilen sonuclar UPGMA (The unweighted pair-group method with arithmetic average analysis) analizine gore izolatlar arasinda 0.15-0.90 oraninda degisen benzerlik elde edilmistir. Ayrica, cophenetic correlation degeri r=0.93 ile oldukca yuksek bulunmustur. Cluster analizi sonuclari degerlendirildiginde marul izolatlari diger izolatlara gore oldukca uzak kumelenmistir. Ayrica, tum izolatlar icin tranpozabl elementler ( Flipper ve Boty ) arastirilmis ve sadece Flipper element tespit edilmistir. Elde edilen genetik karakterizasyon sonuclarina gore, B. cinerea populasyonunda oldukca yuksek seviyede genetik farkliliklar bulunmustur. Bu durum, B. cinerea’ nin evrimsellesme potensiyeli ve gen akislarindan kaynaklanabilir. Farkli konukculardan elde edilen bu patojenin genetik farkliliklarinin belirlenmesinde kullanilan molekuler markirlar, ileride yapilacak calismalara da isik tutmaktadir.
求助全文
通过发布文献求助,成功后即可免费获取论文全文。 去求助
来源期刊
自引率
0.00%
发文量
0
审稿时长
24 weeks
期刊最新文献
Gama Işınıyla (Kobalt 60) Elde Edilmiş Mutant Elma Popülasyonunda Sonbahar Yaprak Renk Değişimi Çukurova Koşullarında Farklı Su Düzeylerinin Tatlı Sorgumun Biyokütle Verimine ve Yem Kalitesine Etkileri Sodyum azid (NaN3) ile muamele edilen arpa mutantlarının genetik çeşitliliğinin ISSR markörler ile belirlenmesi Kültür koşullarında yetiştirilen farklı origanum spp. türlerinin bazı verim ve kalite parametreleri Muğla-Dalaman yöresi sulama sularının sulama suyu kalitelerinin belirlenmesi ve mevsimsel değişiminin incelenmesi
×
引用
GB/T 7714-2015
复制
MLA
复制
APA
复制
导出至
BibTeX EndNote RefMan NoteFirst NoteExpress
×
×
提示
您的信息不完整,为了账户安全,请先补充。
现在去补充
×
提示
您因"违规操作"
具体请查看互助需知
我知道了
×
提示
现在去查看 取消
×
提示
确定
0
微信
客服QQ
Book学术公众号 扫码关注我们
反馈
×
意见反馈
请填写您的意见或建议
请填写您的手机或邮箱
已复制链接
已复制链接
快去分享给好友吧!
我知道了
×
扫码分享
扫码分享
Book学术官方微信
Book学术文献互助
Book学术文献互助群
群 号:481959085
Book学术
文献互助 智能选刊 最新文献 互助须知 联系我们:info@booksci.cn
Book学术提供免费学术资源搜索服务,方便国内外学者检索中英文文献。致力于提供最便捷和优质的服务体验。
Copyright © 2023 Book学术 All rights reserved.
ghs 京公网安备 11010802042870号 京ICP备2023020795号-1