Hüseyin Güngör, M. Akbudak, Ertuğrul Fi̇li̇z, İlker Yüce, Z. Dumlupinar
{"title":"Sodyum azid (NaN3) ile muamele edilen arpa mutantlarının genetik çeşitliliğinin ISSR markörler ile belirlenmesi","authors":"Hüseyin Güngör, M. Akbudak, Ertuğrul Fi̇li̇z, İlker Yüce, Z. Dumlupinar","doi":"10.16882/derim.2020.630502","DOIUrl":null,"url":null,"abstract":"Sodyum azid (NaN3) ozellikle nokta mutasyon calismalarinda yogun olarak kullanilan kimyasal bir mutajendir. Bu calismada, Finola alti sirali arpa cesidi, kimyasal bir mutajen olan sodyum azid ile muamele edilerek 14 adet mutant arpa hatti elde edilmistir. Elde edilen hatlar arasindaki genetik farklilik, 5 adet basit tekrarli diziler arasi polimorfizm (Inter Simple Sequence Repeat, ISSR) markoru yardimiyla belirlenmistir. Elde edilen sonuclara gore 5 ISSR markorunden 24 adet bant elde edilmis ve bu bantlardan 18 adet polimorfik allel belirlenmis ve ortalama polimorfizm orani %76.33 olarak saptanmistir. Ortalama allel sayisi 4.8 olup, 6 bant ile UBC-808 en fazla bant ureten primer olurken, en az bant ureten primerler ise 4’er bant ile UBC-820 ve UBC-825 primerleri olmustur. Kullanilan markorlere ait ortalama polimorfizm bilgi icerigi (PIC) 0.83 olarak hesaplanmis ve PIC degeri 0.78 ile 0.86 araliginda degismistir. Markor verileri dendrogramda 2 ana grup olusturmustur. Birinci kumede Fnl-4, Fnl-8, Fnl-10, Fnl-11 ve Fnl-12 mutantlari yer alirken, ikinci kumede ise Finola cesidi ile birlikte diger mutant hatlar yer almaktadir. Temel bilesenler analizi, Finola cesidi ve mutant hatlardan Fnl-5, Fnl-13 ve Fnl-14 hatlarinin birbirine benzemekle birlikte, bazi alleller bakimindan farkli olduklarini ortaya koymustur.","PeriodicalId":30721,"journal":{"name":"Derim","volume":" ","pages":""},"PeriodicalIF":0.0000,"publicationDate":"2020-06-01","publicationTypes":"Journal Article","fieldsOfStudy":null,"isOpenAccess":false,"openAccessPdf":"","citationCount":"2","resultStr":null,"platform":"Semanticscholar","paperid":null,"PeriodicalName":"Derim","FirstCategoryId":"1085","ListUrlMain":"https://doi.org/10.16882/derim.2020.630502","RegionNum":0,"RegionCategory":null,"ArticlePicture":[],"TitleCN":null,"AbstractTextCN":null,"PMCID":null,"EPubDate":"","PubModel":"","JCR":"","JCRName":"","Score":null,"Total":0}
引用次数: 2
摘要
叠氮化钠(NaN3)是点突变中常用的一种化学突变。Bu calimada,Finola alti sirali arpa cesidi,kimyasal bir mutajen olan sodyum azid ile muamele edilerek 14 adet突变体arpa hatti elde edilmitir。所选品系之间的遗传差异由ISSR标记决定。所获得的结果是24剂ISSR标记长达5年,鉴定出18剂多态等位基因,平均多态率为76.33%。平均等位基因数为4.8,有6个带,UBC-808是最高带宽的水的素数,而最低带宽的水是4个带,有UBC-820和UBC-825个素数。平均多态性信息(PIC)计算为icerigi(PIC)0.83,PIC在0.78和0.86之间降解。标记数据必须由树状图中的两个主要组组成。在第一个沙上,取Fnl-4、Fnl-8、Fnl-10、Fnl-11和Fnl-12突变体,而在第二个沙上用菲诺拉的身体取其他突变体系。基线分析、芬诺拉的身体以及Fnl-5、Fnl-13和Fnl-14的突变株系表明,一些过敏反应与观察者不同。
Sodyum azid (NaN3) ile muamele edilen arpa mutantlarının genetik çeşitliliğinin ISSR markörler ile belirlenmesi
Sodyum azid (NaN3) ozellikle nokta mutasyon calismalarinda yogun olarak kullanilan kimyasal bir mutajendir. Bu calismada, Finola alti sirali arpa cesidi, kimyasal bir mutajen olan sodyum azid ile muamele edilerek 14 adet mutant arpa hatti elde edilmistir. Elde edilen hatlar arasindaki genetik farklilik, 5 adet basit tekrarli diziler arasi polimorfizm (Inter Simple Sequence Repeat, ISSR) markoru yardimiyla belirlenmistir. Elde edilen sonuclara gore 5 ISSR markorunden 24 adet bant elde edilmis ve bu bantlardan 18 adet polimorfik allel belirlenmis ve ortalama polimorfizm orani %76.33 olarak saptanmistir. Ortalama allel sayisi 4.8 olup, 6 bant ile UBC-808 en fazla bant ureten primer olurken, en az bant ureten primerler ise 4’er bant ile UBC-820 ve UBC-825 primerleri olmustur. Kullanilan markorlere ait ortalama polimorfizm bilgi icerigi (PIC) 0.83 olarak hesaplanmis ve PIC degeri 0.78 ile 0.86 araliginda degismistir. Markor verileri dendrogramda 2 ana grup olusturmustur. Birinci kumede Fnl-4, Fnl-8, Fnl-10, Fnl-11 ve Fnl-12 mutantlari yer alirken, ikinci kumede ise Finola cesidi ile birlikte diger mutant hatlar yer almaktadir. Temel bilesenler analizi, Finola cesidi ve mutant hatlardan Fnl-5, Fnl-13 ve Fnl-14 hatlarinin birbirine benzemekle birlikte, bazi alleller bakimindan farkli olduklarini ortaya koymustur.