哥斯达黎加萨拉皮基和瓜图索与黑胡椒栽培相关的镰刀菌属物种的分子形态鉴定

Gabriela Chinchilla Salazar, Mónica Blanco Meneses, Óscar Castro Zúñiga
{"title":"哥斯达黎加萨拉皮基和瓜图索与黑胡椒栽培相关的镰刀菌属物种的分子形态鉴定","authors":"Gabriela Chinchilla Salazar, Mónica Blanco Meneses, Óscar Castro Zúñiga","doi":"10.15517/rac.v44i2.43087","DOIUrl":null,"url":null,"abstract":"espanolLa pimienta es una especie de la familia de la Piperaceae, originaria de la Costa de Malabar, situada en Kerala al sur de la India. En Costa Rica, las principales plantaciones de pimienta se localizan desde Upala hasta Talamanca, e incluye toda la franja costera y la parte baja de Sarapiqui. Segun estudios de factibilidad, el pais cuenta con el potencial para producir pimienta con altos parametros de calidad. Sin embargo, las enfermedades vasculares son una de las principales limitantes del cultivo. Objetivo. El objetivo de esta investigacion fue el aislamiento e identificacion molecular y morfologica de las especies de Fusarium asociadas al cultivo de la pimienta (Piper nigrum L.) en 2 de las principales zonas productoras del pais. Materiales y metodos. Se recolectaron treinta muestras de plantas enfermas de distintas fincas en las zonas de Sarapiqui y Guatuso, se describieron detalladamente los sintomas observados en el sistema radical y/o la base del tallo para cada una de las plantas recolectadas. Los veintiun aislamientos de Fusarium spp. obtenidos se identificaron molecularmente con la secuencia parcial del gen Factor de Elongacion 1α (EF-1α) y para la identificacion morfologica se utilizaron los medios de cultivo PDA y Carnation Leaf-piece Agar (CLA). Resultados y conclusiones. Se confirmo la presencia de Fusarium oxysporum en las muestras provenientes de Sarapiqui, asi como la presencia de Fusarium solani en ambas zonas muestreadas. Se reporta por primera vez, la presencia de las especies Fusarium concentricum y Fusarium proliferatum asociadas a la marchitez vascular. EnglishPepper is one of the Piperaceae family, native to the Malabar Coast, located in Kerala in Southern India. In Costa Rica, main pepper plantations are located from Upala to Talamanca including the entire coastal and lower strip of Sarapiqui. According to feasibility studies, Costa Rica has the potential to produce pepper with high quality parameters; however, vascular diseases are one of the main crop limitations. Objective. To isolatate, and molecularly and morphologically identify species of Fusarium associated with the cultivation of pepper (Piper nigrum L.) in 2 of the main productive areas of the country. Materials and methods. Thirty samples from diseased plants were collected from different farms located in Sarapiqui and Guatuso, symptoms observed in the adical system and/or the stem base were described in detail for each plant. The twenty one isolates of Fusarium spp. obtained were identified with the partial sequence of the molecular marker Elongation Factor 1α (EF-1α) gene and for the morphogical identification using the PDA and Carnation Leaf Agar (CLA) culture media were used. Results and conclusions. The presence of Fusarium oxysporum was confirmed in the samples from Sarapiqui, and the presence of Fusarium solani was confirmed in the samples from both areas. The presence of the species Fusarium concentricum and Fusarium proliferatum associated with vascular wilt is reported for the first time.","PeriodicalId":31178,"journal":{"name":"Agronomia Costarricense","volume":null,"pages":null},"PeriodicalIF":0.0000,"publicationDate":"2020-07-22","publicationTypes":"Journal Article","fieldsOfStudy":null,"isOpenAccess":false,"openAccessPdf":"","citationCount":"0","resultStr":"{\"title\":\"Identificación molecular morfológica de las especies de Fusarium spp., asociadas al cultivo de pimienta negra (Piper nigrum) en Sarapiquí y Guatuso en Costa Rica\",\"authors\":\"Gabriela Chinchilla Salazar, Mónica Blanco Meneses, Óscar Castro Zúñiga\",\"doi\":\"10.15517/rac.v44i2.43087\",\"DOIUrl\":null,\"url\":null,\"abstract\":\"espanolLa pimienta es una especie de la familia de la Piperaceae, originaria de la Costa de Malabar, situada en Kerala al sur de la India. 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摘要

胡椒是胡椒科的一种,原产于印度南部喀拉拉邦马拉巴尔海岸。在哥斯达黎加,主要的胡椒种植园位于乌帕拉至塔拉曼卡,包括整个沿海地带和萨拉皮基的下半部。根据可行性研究,该国有潜力生产高质量参数的辣椒。然而,血管疾病是作物的主要限制因素之一。目标。这项研究的目的是分离和鉴定该国2个主要产区与辣椒栽培有关的镰刀菌物种(黑胡椒)。材料和方法。从萨拉皮基和瓜图索地区不同农场收集了30个患病植物样本,详细描述了所收集的每种植物在根系统和/或茎基中观察到的症状。获得的21株镰刀菌分离物用延伸因子1α(EF-1α)基因的部分序列进行了分子鉴定,并用PDA和肉豆蔻叶片琼脂(CLA)培养基进行了形态鉴定。结果和结论。确认来自萨拉皮基的样本中存在尖孢镰刀菌,以及两个样本区域中都存在索拉尼镰刀菌。首次报告了与血管萎蔫相关的同心镰刀菌和增殖镰刀菌物种的存在。英式胡椒是胡椒科植物之一,原产于印度南部喀拉拉邦的马拉巴尔海岸。在哥斯达黎加,主要的辣椒种植园位于乌帕拉至塔拉曼卡,包括整个海岸和萨拉皮基的下半部。根据可行性研究,哥斯达黎加有可能生产高质量参数的辣椒;然而,血管疾病是主要的作物限制之一。目标。分离,并在分子和形态上识别与该国2个主要生产区辣椒(胡椒)种植相关的镰刀菌物种。材料和方法。从萨拉皮基和瓜图索的不同农场收集了30份疾病植物样本,详细描述了每个植物在成瘾系统和/或干基中观察到的症状。获得的21个镰刀菌分离株与分子标记延伸因子1α(EF-1α)基因的部分序列进行了鉴定,并使用PDA和肉食叶琼脂培养基进行了形态鉴定。结果和结论。在萨拉皮基的样本中证实了尖孢镰刀菌的存在,在两个地区的样本中证实了索拉尼镰刀菌的存在。首次报道了与血管萎缩症相关的浓缩镰刀菌和增殖镰刀菌的存在。
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Identificación molecular morfológica de las especies de Fusarium spp., asociadas al cultivo de pimienta negra (Piper nigrum) en Sarapiquí y Guatuso en Costa Rica
espanolLa pimienta es una especie de la familia de la Piperaceae, originaria de la Costa de Malabar, situada en Kerala al sur de la India. En Costa Rica, las principales plantaciones de pimienta se localizan desde Upala hasta Talamanca, e incluye toda la franja costera y la parte baja de Sarapiqui. Segun estudios de factibilidad, el pais cuenta con el potencial para producir pimienta con altos parametros de calidad. Sin embargo, las enfermedades vasculares son una de las principales limitantes del cultivo. Objetivo. El objetivo de esta investigacion fue el aislamiento e identificacion molecular y morfologica de las especies de Fusarium asociadas al cultivo de la pimienta (Piper nigrum L.) en 2 de las principales zonas productoras del pais. Materiales y metodos. Se recolectaron treinta muestras de plantas enfermas de distintas fincas en las zonas de Sarapiqui y Guatuso, se describieron detalladamente los sintomas observados en el sistema radical y/o la base del tallo para cada una de las plantas recolectadas. Los veintiun aislamientos de Fusarium spp. obtenidos se identificaron molecularmente con la secuencia parcial del gen Factor de Elongacion 1α (EF-1α) y para la identificacion morfologica se utilizaron los medios de cultivo PDA y Carnation Leaf-piece Agar (CLA). Resultados y conclusiones. Se confirmo la presencia de Fusarium oxysporum en las muestras provenientes de Sarapiqui, asi como la presencia de Fusarium solani en ambas zonas muestreadas. Se reporta por primera vez, la presencia de las especies Fusarium concentricum y Fusarium proliferatum asociadas a la marchitez vascular. EnglishPepper is one of the Piperaceae family, native to the Malabar Coast, located in Kerala in Southern India. In Costa Rica, main pepper plantations are located from Upala to Talamanca including the entire coastal and lower strip of Sarapiqui. According to feasibility studies, Costa Rica has the potential to produce pepper with high quality parameters; however, vascular diseases are one of the main crop limitations. Objective. To isolatate, and molecularly and morphologically identify species of Fusarium associated with the cultivation of pepper (Piper nigrum L.) in 2 of the main productive areas of the country. Materials and methods. Thirty samples from diseased plants were collected from different farms located in Sarapiqui and Guatuso, symptoms observed in the adical system and/or the stem base were described in detail for each plant. The twenty one isolates of Fusarium spp. obtained were identified with the partial sequence of the molecular marker Elongation Factor 1α (EF-1α) gene and for the morphogical identification using the PDA and Carnation Leaf Agar (CLA) culture media were used. Results and conclusions. The presence of Fusarium oxysporum was confirmed in the samples from Sarapiqui, and the presence of Fusarium solani was confirmed in the samples from both areas. The presence of the species Fusarium concentricum and Fusarium proliferatum associated with vascular wilt is reported for the first time.
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