生体分子の分子動力学シミュレーション(1)方法

Abstract

分子動力学シミュレーションは、タンパク質やDNAなどの生体高分子の構造・物性・機能相関の研究に有用であることが認められている。本総説では、筆者らが開発したソフトウェアPEACH（Program for Energetic Analysis of bioChemical molecules）に導入した機能を中心に、生体高分子の分子動力学シミュレーションの方法を概観する。