Chromindex-UdeC, a simple method for calculating karyotypic asymmetry indices from Excel tables generated by the MicroMeasure program

IF 0.4 4区生物学 Q4 PLANT SCIENCES GAYANA BOTANICA Pub Date : 2023-06-01 DOI:10.4067/s0717-66432023000100075

Carlos Baeza Perry, Alvaro Guzmán Chacón, Pedro Pinacho-Davidson

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Abstract

MicroMeasure es un programa cientÃfico de anÃ¡lisis de imÃ¡genes, cuya aplicaciÃ³n estÃ¡ destinada a estudios citolÃ³gicos, citogenÃ©ticos y citotaxonÃ³micos. Este programa estÃ¡ diseÃ±ado especÃficamente para la mediciÃ³n lineal de los cromosomas utilizando fundamentalmente el centrÃ³mero de cada cromosoma como punto crucial para la mediciÃ³n de los dos brazos de cada uno de ellos. Los datos se calculan automÃ¡ticamente, dando como resultado una hoja de cÃ¡lculo Excel. A partir de esta tabla Excel, se pueden hacer una multiplicidad de cÃ¡lculos, dependiendo de las necesidades e intereses de cada investigador. Chromindex-UdeC permite utilizar tablas Excel mÃºltiples, generadas por el programa MicroMeasure y solo deben ser subidas al servidor para calcular automÃ¡ticamente los Ãndices de asimetrÃa disponibles(A2, AsK%, CVCL, CVCI,MCA, Syi, %TF). Este programa puede ser usado en espaÃ±ol y/o en inglÃ©s y no se necesita ninguna experiencia en programaciÃ³n, es gratis, estÃ¡ disponible en una plataforma abierta a todo pÃºblico y se actualiza automÃ¡ticamente.

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Chromindex-UdeC，从MicroMeasure程序生成的Excel表格中计算核型不对称指数的简单方法

一个ÃMicroMeasure就是cientÃ-fico¡lisis的imÃ¡基因,其aplicaciÃ³n’estÃ¡旨在研究citolÃ³gicos, citogenÃ©ticos和citotaxonÃ³micos。该方案estÃ¡一下设计Ã±ado特别Ã-ficamente为mediciÃ³n的线性染色体主要运用centrÃ³每个染色体仅作为转折点mediciÃ³n两个他们各自的怀抱。数据估计automÃ¡ticamente,产生了一片叶子cÃ¡lculo Excel。从这个Excel表,可做多种cÃ¡lculos,根据每名研究人员的需要和利益。Chromindex-UdeC允许使用Excel表格mÃºltiples MicroMeasure方案所产生的,只需要向服务器上传计算automÃ¡ticamente的Ã-ndices asimetr的可利用Ã- a (A2,请问%,CVCL CVCI MCA、Syi % TF)。该方案可以被用来在西班牙Ã±1和/或在整理Ã©s和不需要任何经验programaciÃn³,是免费的,estÃ¡于开放平台所有pÃºblico和更新automÃ¡ticamente。

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GAYANA BOTANICA Agricultural and Biological Sciences-Plant Science

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