单细胞阴茎癌图谱确定疾病驱动因素

阴茎鳞状细胞癌（PSCC）可分为人类乳头状瘤病毒阳性（HPV+）和HPV-独立型（HPV-）。与 HPV- 型肿瘤相比，HPV+ 型肿瘤的分化不良率更高。不过，据报道，HPV+患者的癌症特异性死亡率（CSM）低于HPV-患者。在发表于《欧洲泌尿学》（European Urology）的一项研究中，我们建立了一个 PSCC 单细胞 RNA 测序（scRNA-seq）图谱，以确定可能解释 HPV+ 和 HPV- 肿瘤患者预后差异的分子特征。研究人员对 16 例未经治疗的原发性 PSCC 患者的新鲜肿瘤样本和 6 例非恶性包皮内侧样本进行了 scRNA-seq 和 T 细胞受体测序。根据 HPV 和 TP53 状态共定义了四组：正常（n = 6）、HPV+ TP53 野生型（WT；n = 6）、HPV- TP53WT（n = 6）和 TP53LOF（无论 HPV 状态如何；n = 4）。对来自一个独立国际队列的患者进行的CSM分析验证了这些组别的预后相关性，TP53突变肿瘤患者的预后明显差于TP53WT肿瘤患者（P = 0.002）。scRNA-seq分析结果显示，TP53LOF肿瘤具有侵袭性表型，其特征是上皮细胞向间质转化、血管生成和免疫排斥的基因特征。HPV- TP53WT肿瘤表现出免疫衰竭，而HPV+ TP53WT肿瘤则表现出正常的上皮成熟和多个抗体-药物共轭靶点的上调，这表明其具有潜在的治疗作用。