NCBI: GENERALIDADES DEL REPOSITORIO Y BREVE DESCRIPCIÓN DE RECURSOS APLICABLES AL ESTUDIO DE LA FITOGENÉTICA

IF 0.4 4区农林科学 Q4 AGRONOMY Revista Fitotecnia Mexicana Pub Date : 2023-03-31 DOI:10.35196/rfm.2023.1.63

Oswaldo Guzmán-López, Celeste Ricaño-Rodríguez, Daniela Luis-Yong, J. Ricaño-Rodríguez

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Abstract

El Centro Nacional para la Información Biotecnológica (NCBI) proporciona acceso a un conjunto de recursos computacionales que permiten el conocimiento de sistemas biológicos; además, en éste se incluyen diversos repositorios de secuencias genómicas y proteicas, citas y resúmenes científicos referentes a las ciencias naturales y de la salud. En virtud de lo anterior, el objetivo de este trabajo fue llevar a cabo una recopilación de generalidades del NCBI, tomando como base de organización del documento los siguientes elementos: el sistema Entrez, fuentes de información y actualización de literatura, incluyendo la base de datos de taxonomía, gestión de metadatos y expresión genética, gestión de colecciones de secuencias nucleotídicas, procesamiento de secuencias genómicas y proteicas. De manera complementaria, se describen algunas herramientas aplicables al estudio de la fitogenética que han apoyado el ensamble de genomas completos de plantas; además, se discuten de manera breve algunos resultados de investigaciones derivados del uso de recursos bioinformáticos como anotaciones genómicas, generación y organización de metadatos, estudios de expresión genética incluyendo transcriptómica, búsqueda de alineaciones nucleotídicas locales y globales, así como estructuración y modelación tridimensional de proteínas, entre otros.

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NCBI:植物遗传学研究中应用资源的概述和简要描述

国家生物技术信息中心(NCBI)提供一套计算资源，使生物系统知识成为可能;此外，它还包括与自然和健康科学有关的基因组和蛋白质序列、引用和科学摘要的各种存储库。根据以上所述,这项工作的目的是开展收集NCBI的概览文件组织,根据以下内容:Entrez,信息来源和更新系统,包括文学分类数据库管理、元数据和言论自由、藏品管理基因序列nucleotídicas、序列genómicas和proteicas加工。此外，还描述了一些适用于植物遗传学研究的工具，这些工具支持了完整植物基因组的组装;此外,简短地讨论了一些研究成果利用bioinformáticos资源所得的像元、发电和安排基因组注释、基因表达的研究包括transcriptómica,国内和全球nucleotídicas、查询以及结构蛋白和三维建模等。

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Revista Fitotecnia Mexicana 农林科学-农艺学

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18-36 weeks

期刊介绍： La Revista Fitotecnia Mexicana es un órgano de difusión de la Sociedad Mexicana de Fitogenética que publica trabajos científicos, originales e inéditos, referentes a las ciencias biológicas aplicadas a recursos genéticos, producción agrícola, biotecnología vegetal, fitomejoramiento genético, fisiología vegetal, tecnología de alimentos vegetales, y otras áreas afines.