Mitochondrial DNA phylogeography of the Bushtit (Psaltriparus minimus)

Pub Date : 2023-03-15 DOI:10.1676/22-00013
R. Zink, G. Spellman, Ricardo Canales-Del-Castillo, Kevin L. Epperly, J. Klicka
{"title":"Mitochondrial DNA phylogeography of the Bushtit (Psaltriparus minimus)","authors":"R. Zink, G. Spellman, Ricardo Canales-Del-Castillo, Kevin L. Epperly, J. Klicka","doi":"10.1676/22-00013","DOIUrl":null,"url":null,"abstract":"ABSTRACT We sequenced the mitochondrial ND2 gene for 290 Bushtits (Psaltriparus minimus) sampled from northern Washington to Guatemala. Phylogenetic analysis sorted specimens into 2 main lineages residing either west (coastal) or east (inland) of the Sierra Nevada and Cascades. These lineages are separated by 3.5% sequence divergence and correspond with the distributions of 2 long-recognized phenotype groupings (brown-capped and plumbeous, respectively). Three additional monophyletic geographically structured lineages were identified. Birds from southmost Baja California (Sierra de la Laguna) segregate from other coastal samples whereas the inland lineage includes additional lineages occurring in southeastern Mexico (Morelos, Puebla, Guerrero, and Oaxaca) plus Guatemala, and southwestern Mexico (Michoacán). Examination of museum specimens revealed that a black-eared phenotype occurs sporadically in the interior lineage in southern U.S. and northern Mexico, increasing in frequency to the south, corresponding roughly with these southern Mexican mtDNA lineages. Degree of sequence divergence between the 2 main lineages suggests a relatively early divergence, and ample time for 2-way introgression to occur. However, only 1 of our sampling localities (Lake Co., Oregon; n = 4) was mixed for coastal (n = 1) and interior (n = 3) lineages suggesting the possibility of reproductive isolation between the 2 main lineages. RESUMEN (Spanish) Secuenciamos el gen mitocondrial ND2 de 290 mitos colectados desde el norte de Washington hasta Guatemala. Los análisis filogenéticos clasificaron a los especímenes en 2 linajes principales que residían ya sea en al oeste (costero) o al este (interior) de la Sierra Nevada y Cascades. Estos linajes se separan por una divergencia de secuencias de 3.5% y corresponden a distribuciones de 2 agrupamientos fenotípicos reconocidos desde hace mucho tiempo (respectivamente capucha marrón y plomizo). Se reconocieron tres linajes adicionales monofiléticos estructurados geográficamente. Aves de la parte más sureña de Baja California (Sierra de la Laguna) se segregan de otras muestras costeras mientras que linajes del interior incluyen otros linajes que se encuentran en el sudeste mexicano (Morelos, Puebla, Guerrero y Oaxaca), sumado a Guatemala y al sudoeste mexicano (Michoacán). La examinación de especímenes de museo reveló que un fenotipo de oreja negra se encuentra esporádicamente en el linaje interior en el sudeste de Estados Unidos y norte de México, que aumenta su frecuencia hacia el sur y corresponde en general con linajes mtADN del sudeste mexicano. El grado de divergencia de secuencias entre los 2 linajes principales sugiere una divergencia relativamente temprana y un tiempo grande para que ocurriera una introgresión de 2 vías. Sin embargo, solo una de las localidades de muestreo (Lake Co., Oregon, n = 4) presentaba una mezcla de linajes costero (n = 1) e interior (n = 3), sugiriendo la posibilidad de aislamiento reproductivo entre los 2 linajes principales. Palabras clave: ADN mitocondrial, árbol genético, divergencia de linaje, filogeografía, modelos de nicho.","PeriodicalId":0,"journal":{"name":"","volume":null,"pages":null},"PeriodicalIF":0.0,"publicationDate":"2023-03-15","publicationTypes":"Journal Article","fieldsOfStudy":null,"isOpenAccess":false,"openAccessPdf":"","citationCount":"0","resultStr":null,"platform":"Semanticscholar","paperid":null,"PeriodicalName":"","FirstCategoryId":"99","ListUrlMain":"https://doi.org/10.1676/22-00013","RegionNum":0,"RegionCategory":null,"ArticlePicture":[],"TitleCN":null,"AbstractTextCN":null,"PMCID":null,"EPubDate":"","PubModel":"","JCR":"","JCRName":"","Score":null,"Total":0}
引用次数: 0

Abstract

ABSTRACT We sequenced the mitochondrial ND2 gene for 290 Bushtits (Psaltriparus minimus) sampled from northern Washington to Guatemala. Phylogenetic analysis sorted specimens into 2 main lineages residing either west (coastal) or east (inland) of the Sierra Nevada and Cascades. These lineages are separated by 3.5% sequence divergence and correspond with the distributions of 2 long-recognized phenotype groupings (brown-capped and plumbeous, respectively). Three additional monophyletic geographically structured lineages were identified. Birds from southmost Baja California (Sierra de la Laguna) segregate from other coastal samples whereas the inland lineage includes additional lineages occurring in southeastern Mexico (Morelos, Puebla, Guerrero, and Oaxaca) plus Guatemala, and southwestern Mexico (Michoacán). Examination of museum specimens revealed that a black-eared phenotype occurs sporadically in the interior lineage in southern U.S. and northern Mexico, increasing in frequency to the south, corresponding roughly with these southern Mexican mtDNA lineages. Degree of sequence divergence between the 2 main lineages suggests a relatively early divergence, and ample time for 2-way introgression to occur. However, only 1 of our sampling localities (Lake Co., Oregon; n = 4) was mixed for coastal (n = 1) and interior (n = 3) lineages suggesting the possibility of reproductive isolation between the 2 main lineages. RESUMEN (Spanish) Secuenciamos el gen mitocondrial ND2 de 290 mitos colectados desde el norte de Washington hasta Guatemala. Los análisis filogenéticos clasificaron a los especímenes en 2 linajes principales que residían ya sea en al oeste (costero) o al este (interior) de la Sierra Nevada y Cascades. Estos linajes se separan por una divergencia de secuencias de 3.5% y corresponden a distribuciones de 2 agrupamientos fenotípicos reconocidos desde hace mucho tiempo (respectivamente capucha marrón y plomizo). Se reconocieron tres linajes adicionales monofiléticos estructurados geográficamente. Aves de la parte más sureña de Baja California (Sierra de la Laguna) se segregan de otras muestras costeras mientras que linajes del interior incluyen otros linajes que se encuentran en el sudeste mexicano (Morelos, Puebla, Guerrero y Oaxaca), sumado a Guatemala y al sudoeste mexicano (Michoacán). La examinación de especímenes de museo reveló que un fenotipo de oreja negra se encuentra esporádicamente en el linaje interior en el sudeste de Estados Unidos y norte de México, que aumenta su frecuencia hacia el sur y corresponde en general con linajes mtADN del sudeste mexicano. El grado de divergencia de secuencias entre los 2 linajes principales sugiere una divergencia relativamente temprana y un tiempo grande para que ocurriera una introgresión de 2 vías. Sin embargo, solo una de las localidades de muestreo (Lake Co., Oregon, n = 4) presentaba una mezcla de linajes costero (n = 1) e interior (n = 3), sugiriendo la posibilidad de aislamiento reproductivo entre los 2 linajes principales. Palabras clave: ADN mitocondrial, árbol genético, divergencia de linaje, filogeografía, modelos de nicho.
查看原文
分享 分享
微信好友 朋友圈 QQ好友 复制链接
Bushtit(Psaltriparus minimus)的线粒体DNA系统地理学
摘要:研究人员对来自华盛顿北部至危地马拉的290只小矮背鼩鼱(Psaltriparus minimus)进行了线粒体ND2基因测序。系统发育分析将标本分为两个主要谱系,分别位于内华达山脉和喀斯喀特山脉的西部(沿海)和东部(内陆)。这些谱系之间有3.5%的序列差异,并与两个长期公认的表型群(分别为褐顶和铅垂)的分布相对应。另外确定了三个单系地理结构谱系。来自最南端的下加利福尼亚州(Sierra de la Laguna)的鸟类与其他沿海样本分离,而内陆谱系包括墨西哥东南部(莫雷洛斯州,普埃布拉州,格雷罗州和瓦哈卡州)以及危地马拉和墨西哥西南部(Michoacán)的额外谱系。对博物馆标本的检查显示,黑耳表型在美国南部和墨西哥北部的内部谱系中零星发生,在南部的频率增加,大致与这些墨西哥南部的mtDNA谱系相对应。两个主要谱系之间的序列分化程度表明分化相对较早,有充足的时间发生双向渗入。然而,只有1个采样地点(Lake Co., Oregon;沿海谱系(N = 1)和内陆谱系(N = 3)混合,表明两个主要谱系之间可能存在生殖隔离。resume(西班牙语)危地马拉首都华盛顿北部地区的第2次会议。Los análisis filogenasticos classiacificon a Los especímenes en 2 linajes principales que residían ya sea en aleste (costero)或aleste (interior) de la Sierra Nevada and Cascades。Estos linajes的分离性和差异性(disgencia de divergencia de sequencia)的比值为3.5%,对应于分布性(distribuciones de agrupamientos fenotípicos)和分布性(distribuciones de conocidos desdeso)的比值为3.5%(分别为:(:(分别)capucha marrón y plomizo)。我们发现了一种新的方法,即:单胞嘧啶-单胞嘧啶-结构嘧啶geográficamente。下加利福尼亚山脉(拉古纳山脉)、墨西哥内陆地区、墨西哥南部地区(莫雷洛斯州、普埃布拉州、格雷罗州和瓦哈卡州)、危地马拉和墨西哥南部地区(Michoacán)。网址:examinación网址:especímenes网址:reveló网址:especímenes网址:reveló网址:esporádicamente网址:esporádicamente网址:esporádicamente网址:esporádicamente网址:https://www.ac.org/org/inde.org/inde.org/inde.org/inde.org/inde.org/inde.org/inde.org/inde.org/inde.org/inde.org/inde.org/inde.org/inde.org/inde.html网址:https://inde.org/inde.html网址:https://inde.org/inde.html网址:https://inde.org/inde.html网址:https://inde.org/inde.html网址:https://inde.org/inde.html网址:https://inde.org/inde.html网址:https://inde.org/inde.html网址:https://inde.org/inde.html网址:https://inde.org/inde.html研究结果表明,在时间上的差异与时间上的差异与时间上的差异的关系与时间上的差异有关introgresión de 2 vías。自1993年以来,俄勒冈州莱克公司(Lake Co.,俄勒冈州,n = 4)提出了一项关于生殖中心的法律(n = 1)和内部(n = 3)、关于生殖中心的可能性的法律(n = 3)和2项法律原则。Palabras clave: ADN线粒体,árbol genacei, divergencia de linaje, filogeografía, modelos de nicho。
本文章由计算机程序翻译,如有差异,请以英文原文为准。
求助全文
约1分钟内获得全文 去求助
×
引用
GB/T 7714-2015
复制
MLA
复制
APA
复制
导出至
BibTeX EndNote RefMan NoteFirst NoteExpress
×
×
提示
您的信息不完整,为了账户安全,请先补充。
现在去补充
×
提示
您因"违规操作"
具体请查看互助需知
我知道了
×
提示
现在去查看 取消
×
提示
确定
0
微信
客服QQ
Book学术公众号 扫码关注我们
反馈
×
意见反馈
请填写您的意见或建议
请填写您的手机或邮箱
已复制链接
已复制链接
快去分享给好友吧!
我知道了
×
扫码分享
扫码分享
Book学术官方微信
Book学术文献互助
Book学术文献互助群
群 号:481959085
Book学术
文献互助 智能选刊 最新文献 互助须知 联系我们:info@booksci.cn
Book学术提供免费学术资源搜索服务,方便国内外学者检索中英文文献。致力于提供最便捷和优质的服务体验。
Copyright © 2023 Book学术 All rights reserved.
ghs 京公网安备 11010802042870号 京ICP备2023020795号-1