Ege Ve Akdeniz Bölgesindeki Gökkuşağı Alabalıklarından İzole Edilen Flavobacterium psychrophilum Suşlarının Fenotipik Ve Genetik Farklılıklarının Belirlenmesi
{"title":"Ege Ve Akdeniz Bölgesindeki Gökkuşağı Alabalıklarından İzole Edilen Flavobacterium psychrophilum Suşlarının Fenotipik Ve Genetik Farklılıklarının Belirlenmesi","authors":"A. Ersoy, Seçil Metin, Ertan Emek Onuk","doi":"10.22392/EGIRDIR.400641","DOIUrl":null,"url":null,"abstract":"Bu calisma ile Akdeniz bolgesinde bulunan 14 farkli gokkusagi alabaligi (Oncorhynchus mykiss Walbaum, 1792) isletmesinde Flavobacterium psychrophilum’un varligi ile fenotipik ve genotipik ozelliklerinin arastirilmasi hedeflenmistir. Bu amacla Kasim 2012-Mart 2013 tarihleri arasinda ticari alabalik isletmelerinden sperm, yumurta, gozlenmis yumurta, keseli larva ve 0.2-5 gr agirligindaki larvalardan ornekler alinmistir. Orneklerden olasi F. pyschrophilum’un izolasyonu konvansiyonel mikrobiyolojik metotlar kullanilarak yapilmis ve toplamda 172 adet izolat elde edilmistir. Elde edilen tum izolatlarin enzim aktivitesi API ZYM test sistemine gore tespit edilmistir. Yapilan fenotipik testler sonucunda F. psychrophilum oldugu dusunulen 65 izolat belirlenmistir. Bu izolatlarin molekuler olarak dogrulanmasinda F. pyschrophilum spesifik Polimeraz Zincir Reaksiyonu (PCR) metodu kullanilmistir. Hasta baliklardan izole edilen 17 izolatin (11 karaciger, 3 dalak ve 3 bobrek) F. psychrophilum’a ozgu 971 bp’lik bant verdigi saptanmistir. Izolatlar arasi klonal iliskinin belirlenmesi amaciyla RAPD-PCR metodu kullanilmistir. Bu metoda gore F. psychrophilum izolatlarinin bes farkli RAPD bant paterni (F1-F5) verdigi saptanmistir. Izolatlarin % 85 benzerlik katsayisina gore bir “unique” tip (F1 nolu genotip) ve bir kume icerisinde gruplandigi belirlenmistir. Yapilan antibiyogram testi sonucu, izolatlarin trimetroprim/sulfametakzol, klindamisine, ampisillin, tekrasiklin, enrofloksasin, kloramfenikole, oksitetrasiklin, florfenikol ve tobramisin’e duyarli oldugu belirlenmistir. Sonuc olarak, bu calismadan elde edilen bulgular RAPD-PCR'da kullanilan M13 primerinin F. psychrophilum izolatlari arasindaki klonal iliskinin belirlenmesinde kullanilabilir oldugunu gostermistir","PeriodicalId":55833,"journal":{"name":"Suleyman Demirel Universitesi Egirdir Su Urunleri Fakultesi Dergisi","volume":"1 1","pages":""},"PeriodicalIF":0.0000,"publicationDate":"2018-12-01","publicationTypes":"Journal Article","fieldsOfStudy":null,"isOpenAccess":false,"openAccessPdf":"","citationCount":"1","resultStr":null,"platform":"Semanticscholar","paperid":null,"PeriodicalName":"Suleyman Demirel Universitesi Egirdir Su Urunleri Fakultesi Dergisi","FirstCategoryId":"1085","ListUrlMain":"https://doi.org/10.22392/EGIRDIR.400641","RegionNum":0,"RegionCategory":null,"ArticlePicture":[],"TitleCN":null,"AbstractTextCN":null,"PMCID":null,"EPubDate":"","PubModel":"","JCR":"","JCRName":"","Score":null,"Total":0}
引用次数: 1
Abstract
Bu calisma ile Akdeniz bolgesinde bulunan 14 farkli gokkusagi alabaligi (Oncorhynchus mykiss Walbaum, 1792) isletmesinde Flavobacterium psychrophilum’un varligi ile fenotipik ve genotipik ozelliklerinin arastirilmasi hedeflenmistir. Bu amacla Kasim 2012-Mart 2013 tarihleri arasinda ticari alabalik isletmelerinden sperm, yumurta, gozlenmis yumurta, keseli larva ve 0.2-5 gr agirligindaki larvalardan ornekler alinmistir. Orneklerden olasi F. pyschrophilum’un izolasyonu konvansiyonel mikrobiyolojik metotlar kullanilarak yapilmis ve toplamda 172 adet izolat elde edilmistir. Elde edilen tum izolatlarin enzim aktivitesi API ZYM test sistemine gore tespit edilmistir. Yapilan fenotipik testler sonucunda F. psychrophilum oldugu dusunulen 65 izolat belirlenmistir. Bu izolatlarin molekuler olarak dogrulanmasinda F. pyschrophilum spesifik Polimeraz Zincir Reaksiyonu (PCR) metodu kullanilmistir. Hasta baliklardan izole edilen 17 izolatin (11 karaciger, 3 dalak ve 3 bobrek) F. psychrophilum’a ozgu 971 bp’lik bant verdigi saptanmistir. Izolatlar arasi klonal iliskinin belirlenmesi amaciyla RAPD-PCR metodu kullanilmistir. Bu metoda gore F. psychrophilum izolatlarinin bes farkli RAPD bant paterni (F1-F5) verdigi saptanmistir. Izolatlarin % 85 benzerlik katsayisina gore bir “unique” tip (F1 nolu genotip) ve bir kume icerisinde gruplandigi belirlenmistir. Yapilan antibiyogram testi sonucu, izolatlarin trimetroprim/sulfametakzol, klindamisine, ampisillin, tekrasiklin, enrofloksasin, kloramfenikole, oksitetrasiklin, florfenikol ve tobramisin’e duyarli oldugu belirlenmistir. Sonuc olarak, bu calismadan elde edilen bulgular RAPD-PCR'da kullanilan M13 primerinin F. psychrophilum izolatlari arasindaki klonal iliskinin belirlenmesinde kullanilabilir oldugunu gostermistir
Bu calima ile Akdeniz bolgesinde bulunan 14 farkli gokkusagi alabaligi（Oncorhynchus mykiss Walbaum，1792）是一种新型嗜冷黄杆菌。2012年11月至2013年3月，目标是包括精子、卵子、卵子、切割幼虫和0.2-5灰色蔬菜的草本植物。采用传统的微生物学方法从兰花中分离出了嗜pyschrophilum，共分离出172株。在API ZYM测试系统上检测衍生隔离器的酶活性。这些表型测试的结果表明，65个分离株被鉴定为嗜冷镰刀菌。当这些分离物以分子形式形成时，使用嗜pyschrophilum特异性聚合酶链反应（PCR）方法。他表明，从患病的鲸鱼身上分离出的17个分离物（11幅漫画、3颗子弹和3个波波头）给嗜冷冰藻提供了总计971个碱基的序列。RAPD-PCR方法用于确定分离株之间的克隆关系。该方法提示嗜冷镰刀菌分离株产生不同的RAPD抗体（F1-F5）。Izolalarin%85是一种“独特”的尖端（F1基因尖端），它是一种独特的尖端。Yapilan抗体图谱测试sonucu、依佐拉林-曲美他林/磺胺甲恶唑、克林达米辛、氨苄西林、特拉西克林、恩诺氟克松、可乐美芬尼可乐、奥司他曲林、氟苯尼科尔和托巴司新。因此，来自该钙的发现可用于检测RAPD-PCR中使用的M13引物的嗜冷镰刀菌分离株之间的克隆关系。
京公网安备 11010802042870号
京ICP备2023020795号-1
分享
求助内容：
应助结果提醒方式：
扫码关注我们
