Modélisation de la flexibilité métabolique : vers une meilleure compréhension des capacités adaptatives de l’animal

Abstract

Une production durable necessite de disposer d’animaux capables de s’adapter a une diversite croissante de contraintes et perturbations environnementales pour maintenir leurs performances de production. La flexibilite metabolique est un des leviers importants pour la comprehension de l’adaptation individuelle aux perturbations externes. Les elements du metabolisme sont organises en un reseau biologique vaste et complexe, recouvrant differentes echelles d’organisations spatiales et temporelles. Cet article present trois formalismes de modelisation permettant de decrire ce reseau et y associe trois exemples illustratifs du comportement de ce reseau face a des perturbations telles que rencontrees en production animale. Ces formalismes dependent de la taille du (sous)-reseau que l’on souhaite considerer et du type de predictions souhaitees (qualitatives, quantitatives) : i) la modelisation structurelle qui se base sur l’etude des proprietes topologiques d’un reseau de grande taille, ii) la modelisation stœchiometrique qui permet d’analyser les flux metaboliques dans un etat stationnaire et iii) la modelisation dynamique qui permet d’observer l’evolution des acteurs d’un reseau biologique dans le temps.