DOCKING MOLEKULER SENYAWA METABOLIT SEKUNDER Lantana camara SEBAGAI ANTIINFLAMASI TERHADAP ENZIM COX-1

Atim Febry Masula, D. Puspitasari, Eili Supriatin S.W, Khoirul Ummah, Dinik Rokhmatin, M. M. Mubarrok, Ajheng Triyuni Hariza, I. Isnawati, E. R. Purnama
{"title":"DOCKING MOLEKULER SENYAWA METABOLIT SEKUNDER Lantana camara SEBAGAI ANTIINFLAMASI TERHADAP ENZIM COX-1","authors":"Atim Febry Masula, D. Puspitasari, Eili Supriatin S.W, Khoirul Ummah, Dinik Rokhmatin, M. M. Mubarrok, Ajheng Triyuni Hariza, I. Isnawati, E. R. Purnama","doi":"10.19109/biota.v4i2.2172","DOIUrl":null,"url":null,"abstract":"Lantana camara mengandung beberapa jenis flavonoid seperti Umuhengerin, Lantadene A, Lantadene B, Ictero -genin. Salah satu mekanisme kerja flavonoid sebagai antiinflammatoryis dengan menghambat ceptor siklooksigenase (COX). Penelitian ini bertujuan untuk mengetahui afinitas senyawa flavonoid yang terkandung dalam L. camara dengan reseptor COX-1 sebagai antiinflamasi dan untuk mengetahui ikatan hidrogen yang dapat dibentuk dengan metode molecular docking. Pengujian in silico dilakukan berdasarkan metode desain obat yang dibantu komputer. Alat-alat yang digunakan dalam penelitian ini, perangkat lunak PyRx, perangkat lunak PyMol, Pubchem (senyawa database), PDB (Protein Data Bank), dan Po-seView. Berdasarkan hasil docking dan pembahasan di atas dapat disimpulkan bahwa Icterogenin com-pound dan senyawa Umuhengerin adalah senyawa yang paling efektif dalam proses antiinflamasi, Icterogenin com-pound memiliki nilai RMSD 41,1 Å dan nilai afinity mengikat -8,8 dan senyawa Umuhengerin memiliki val-ue RMSD 1, 61 Å dan nilai afinitas pengikatan -8.0. Ini menunjukkan bahwa senyawa tersebut memiliki nilai RMSD dari senyawa Icterogenin. Namun, senyawa Icterogenin memiliki ikatan hidrogen yang lebih kuat dan lebih efisien daripada senyawa Umuhengerin karena nilai afinitas pengikatan terendah.","PeriodicalId":31624,"journal":{"name":"Jurnal Biota","volume":"109 1","pages":""},"PeriodicalIF":0.0000,"publicationDate":"2018-09-20","publicationTypes":"Journal Article","fieldsOfStudy":null,"isOpenAccess":false,"openAccessPdf":"","citationCount":"1","resultStr":null,"platform":"Semanticscholar","paperid":null,"PeriodicalName":"Jurnal Biota","FirstCategoryId":"1085","ListUrlMain":"https://doi.org/10.19109/biota.v4i2.2172","RegionNum":0,"RegionCategory":null,"ArticlePicture":[],"TitleCN":null,"AbstractTextCN":null,"PMCID":null,"EPubDate":"","PubModel":"","JCR":"","JCRName":"","Score":null,"Total":0}
引用次数: 1

Abstract

Lantana camara mengandung beberapa jenis flavonoid seperti Umuhengerin, Lantadene A, Lantadene B, Ictero -genin. Salah satu mekanisme kerja flavonoid sebagai antiinflammatoryis dengan menghambat ceptor siklooksigenase (COX). Penelitian ini bertujuan untuk mengetahui afinitas senyawa flavonoid yang terkandung dalam L. camara dengan reseptor COX-1 sebagai antiinflamasi dan untuk mengetahui ikatan hidrogen yang dapat dibentuk dengan metode molecular docking. Pengujian in silico dilakukan berdasarkan metode desain obat yang dibantu komputer. Alat-alat yang digunakan dalam penelitian ini, perangkat lunak PyRx, perangkat lunak PyMol, Pubchem (senyawa database), PDB (Protein Data Bank), dan Po-seView. Berdasarkan hasil docking dan pembahasan di atas dapat disimpulkan bahwa Icterogenin com-pound dan senyawa Umuhengerin adalah senyawa yang paling efektif dalam proses antiinflamasi, Icterogenin com-pound memiliki nilai RMSD 41,1 Å dan nilai afinity mengikat -8,8 dan senyawa Umuhengerin memiliki val-ue RMSD 1, 61 Å dan nilai afinitas pengikatan -8.0. Ini menunjukkan bahwa senyawa tersebut memiliki nilai RMSD dari senyawa Icterogenin. Namun, senyawa Icterogenin memiliki ikatan hidrogen yang lebih kuat dan lebih efisien daripada senyawa Umuhengerin karena nilai afinitas pengikatan terendah.
查看原文
分享 分享
微信好友 朋友圈 QQ好友 复制链接
本刊更多论文
副代谢化合物Lantana camara作为COX-1酶的消炎药
Lantana camara含有多种类黄酮,如Umuhengerin, Lantadene A, Lantadene B, Ictero -genin。黄酮作为抗炎药物的一种工作机制,通过抑制氧化剂的感受器(考克斯)。研究的目的是确定卡马拉海葵中含有COX-1受体作为抗炎症剂的化合物亲和力,并了解可以用分子对接法形成的氢键。二氧化硅的测试是根据计算机辅助药物的设计方法进行的。本研究使用的工具包括PyRx软件、PyMol软件、Pubchem(数据库的化合物)、gdp(银行的蛋白质数据)和poseview。根据上述对接研究和讨论的结果,我们可以得出结论,ictrogenin com-pound和一般营养素是消化道中最有效的化合物,ictrogenin comerin的价值为41.1这表明该化合物具有ictergenin化合物的RMSD值。然而,icrygenin的化合物比普通化合物更强、更有效,因为它的亲和力是最低的。
本文章由计算机程序翻译,如有差异,请以英文原文为准。
求助全文
约1分钟内获得全文 去求助
来源期刊
自引率
0.00%
发文量
1
审稿时长
24 weeks
期刊最新文献
GC-MS Analysis and In-silico Molecular Docking study of Skin Fruit Arabica Coffee (Coffea arabica L.) Methanol Extract as Mosquito Repellent Analysis of The Diversity Of Butterfly (Rhopalocera) Based On Environmental Conditions In Muria Kudus Tourism Area Central Java Microscopic Characterization of Keji Beling Extract (Strobilanthes crispus L.) As Herbal Medicine Studies Seagrass Vegetation Analysis in Jhembengan and Pasir Putih Beach, Bawean Island, East Java A Cream Formulation Of Extract Of Maja Leaves (Crescentia cujete) As An Antimicrobial Against Staphylococcus aureus
×
引用
GB/T 7714-2015
复制
MLA
复制
APA
复制
导出至
BibTeX EndNote RefMan NoteFirst NoteExpress
×
×
提示
您的信息不完整,为了账户安全,请先补充。
现在去补充
×
提示
您因"违规操作"
具体请查看互助需知
我知道了
×
提示
现在去查看 取消
×
提示
确定
0
微信
客服QQ
Book学术公众号 扫码关注我们
反馈
×
意见反馈
请填写您的意见或建议
请填写您的手机或邮箱
已复制链接
已复制链接
快去分享给好友吧!
我知道了
×
扫码分享
扫码分享
Book学术官方微信
Book学术文献互助
Book学术文献互助群
群 号:481959085
Book学术
文献互助 智能选刊 最新文献 互助须知 联系我们:info@booksci.cn
Book学术提供免费学术资源搜索服务,方便国内外学者检索中英文文献。致力于提供最便捷和优质的服务体验。
Copyright © 2023 Book学术 All rights reserved.
ghs 京公网安备 11010802042870号 京ICP备2023020795号-1