Des animaux plus robustes: un enjeu majeur pour le développement durable des productions animales nécessitant l'essor du phénotypage fin et à haut débit

Abstract

L’enjeu majeur du phenotypage animal est d’acquerir une connaissance systemique de la robustesse des animaux d’elevage pour repondre au mieux a une double finalite en termes d’exploitation de la variabilite des aptitudes animales : une selection eclairee vers des objectifs majeurs pour ameliorer l’efficience et la robustesse des genotypes, et un elevage de precision exploitant la variabilite individuelle des animaux pour gagner en resilience a l’echelle du troupeau, ou pour ameliorer la conduite a genotype donne. Deux defis majeurs de connaissance, interdependants et communs a toutes les filieres animales, sont a relever pour ameliorer la robustesse des animaux : i) comprendre et predire les compromis entre fonctions vitales, c’est-a-dire les changements de priorites dans l’allocation de ressources limitees ; ii) comprendre et exploiter les aspects temporels de la robustesse au cours de la vie de l’animal pour lui permettre de maintenir son niveau de production dans une large gamme d’environnements sans pour autant compromettre sa reproduction, sa sante et son bien-etre. Atteindre ces objectifs necessite de lever les verrous techniques suivants : i) definir des phenotypes complexes a partir de l’integration de donnees obtenues a differentes echelles moleculaires, tissulaires, de l’animal ou d’une de ses fonctions ; ii) mettre en oeuvre des technologies a haut debit pour caracteriser a moindre cout et le plus precisement possible le plus grand nombre d’animaux ; iii) developper d’importantes bases de donnees, des methodes et outils informatiques performants, necessaires aux traitements des informations a des fins de modelisation et de biologie predictive.