Know-How in the Development of a Program for QSAR Platform; PAS

Abstract

1.はじめに 構造活性相関(SAR)においては,特異的部 分構造の有無やその数から,カテゴリーを決定 したり,logPow等の2次的パラメータを作成す る必要がある。そのため,定性的あるいは定量 的な活性推定プログラムにおいて最も重要でか つ困難な部分が,問題とする化学物質から各種 部分構造を抽出して数えるプログラムである。 SARプログラム自身が利用でき,部分構造を 記述する方法が公開されていても,その数え方 のプログラムの詳細はほとんど公開されていな い 。数え方は,各開発者のノウハウであり, それを保持することにより開発の優位性を保つ ことができる。PAS(Platform for Assessment from Structure)においては,直線的構造を木 構造のように組み立てることによって化学物質 の構造を指定する。この指定を解釈して問題構 造中のその部分構造を数える方法をF I TS (Fragment Identification by Tree Structure)と 名付け,その方法のノウハウに関して報告する。