通过超级像素分割和图形切割定量胰腺组织元素

Kame Haung Zhu, F. F. F. Peres, C. Mauricio
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摘要

通过显微镜获得的数字图像是用于各种活动的重要信息来源,其中一些活动涉及疾病诊断和治疗研究。因此,数字图像处理(PDI)技术是帮助数据收集的工具。在此背景下,这项工作涉及到胰腺组织显微图像定量系统的开发。使用的技术包括Python编程语言、Visual Code Studio文本编辑器和Tkinter、OpenCV、Pillow和SciPy库。此外,为了验证系统,我们比较了PySG (Python SLIC Graph-Cut - system)和ImageJ(一种广泛应用于PDI的生物科学开源软件)获得的岛屿区域的结果。在这两个系统中,在图像中绘制岛屿的轮廓,创建一个掩模,从中提取结果。然后进行统计检验,得到p值为0.4849,得出所开发的系统具有与其他具有相同目的的系统相似的功能和性能的结论。
本文章由计算机程序翻译,如有差异,请以英文原文为准。
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Quantificação de Elementos do Tecido Pancreático Através da Segmentação com Superpíxeis e Graph-Cut
Imagens digitais obtidas através de microscópios são importantes fontes de informação utilizadas para diversas atividades, algumas delas envolvem o diagnóstico de doenças e estudo de tratamentos. Assim, técnicas de Processamento Digital de Imagens (PDI) são ferramentas que auxiliam nessa coleta de dados. Neste contexto, este trabalho envolveu o desenvolvimento de um sistema para a quantificação de imagens microscópicas do tecido pancreático. Entre as tecnologias utilizadas, tem-se a linguagem de programação Python, o editor de texto Visual Code Studio e as bibliotecas Tkinter, OpenCV, Pillow e SciPy. Além disso, para a validação do sistema, compararam-se os resultados das áreas das ilhotas obtidos pelo PySG (Python SLIC Graph-Cut – sistema desenvolvido) e ImageJ, um software de acesso livre muito utilizado na área das ciências biológicas para o PDI. Em ambos os sistemas, fez-se o contorno das ilhotas nas imagens, criando-se uma máscara do qual são extraídos os resultados. Então, realizou-se um teste estatístico, obtendo-se um p-valor de 0,4849 e chegando à conclusão de que o sistema desenvolvido é funcional e possuí um desempenho similar a outro sistema com o mesmo propósito.
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