基于MXDORTO的分子动力学模拟结果显示。交互式和简单的显示程序与GUI。

Yutaka Okamoto, T. Sakai, T. Sekizawa
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摘要

为了将MXDORTO的分子动力学模拟得到的物质结构作为三维图形在个人电脑上显示,根据MXDORTO得到的原子排列数据编写了生成VRML文件的程序。生成的VRML文件通过Web浏览器和插件软件,以精细的三维图形形式显示,可变换多种视角观察结构。本程序可在Windows上运行,并具有GUI功能,便于广泛使用。
本文章由计算机程序翻译,如有差异,请以英文原文为准。
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Display of Molecular Dynamics Simulation Results by MXDORTO with Web Browser. Interactive and Simple Display Program with GUI.
MXDORTOによる分子動力学シミュレーションによって得られる物質の構造を3次元グラフィックスとしてパソコン上で表示するため,MXDORTOによって得られた原子配置データからVRMLファイルを生成するプログラムを作成した.生成されたVRMLファイルはWebブラウザーとプラグインソフトを利用することにより,精細な3次元グラフィックスとして表示され,様々に視点を変えて構造を観察することが可能であった.本プログラムはWindows上で動作し,GUIを備えていることから,広く利用しやすいものとなっている.
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