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摘要
分子动力学模拟在研究生物大分子的结构、物性、功能相关方面具有广泛的应用价值。在本总说中,笔者开发的生物分子分析用软件PEACH (Program for Energetic Analysis of bioChemical使用molecules),对蛋白质和DNA的分子动力学进行模拟时的步骤进行实践性解说。
分子動力学シミュレーションは、生体高分子の構造・物性・機能相関の研究に有用であることが一般に認められている。本総説では、筆者らが開発した生体分子解析用ソフトウェアPEACH(Program for Energetic Analysis of bioChemical molecules)を使って、タンパク質とDNAの分子動力学シミュレーションを行う場合の手続きを、実践的に解説する。