甘蔗新成分促进剂的硅勘探与分析

V. H. D. Silva, Alice Loureiro Martins, Marina Luna de Souza Alves, Barbara de Miranda Rost, Michael dos Santos Brito
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Apesar de promotores constitutivos ja caracterizados funcionarem para alguns organismos vegetais, ate o momento ha deficiencia de fortes promotores constitutivos para a engenharia genetica de gramineas, sobretudo na cana-de-acucar (Saccharum officinarum), principal materia-prima utilizada para producao de etanol de primeira e segunda geracao no Brasil. Objetivo: O presente estudo visa avaliar e caracterizar in silico novos promotores constitutivos da cana, bem como seus homologos em Sorgo e Milho, para o desenvolvimento de novos vetores de transformacao eficientes para gramineas. Materiais e metodos: A partir de banco de dados genomicos e transcriptomicos, especificos para a Cana e outras especies correlatas, alem de ferramentas de bioinformatica pretende-se identificar os genes constitutivos e seus homologos, visualizar a sua expressao e encontrar possiveis candidatos para isolar seus promotores genicos e realizar as analises. Resultados parciais: Ate o momento, foi possivel realizar a identificacao de ao menos 10 genes constitutivos da cana-de-acucar e seus homologos em milho e sorgo. Atraves dos testes de expressao de Northern virtual no SuCEST e de forma complementar, em bancos especificos para seus homologos, os genes Fator de Elongacao 1 Delta 1, Proteina Homologa ao FT SUI1 e Arginina tRNA Ligase da cana-de-acucar demonstraram os melhores perfis de expressao. Concomitantemente a isso, iniciamos estudos na prospeccao de novos promotores viriais capazes de conduzir a expressao constitutiva em gramineas.  A proxima etapa consiste em desenhar iniciadores especificos dos promotores endogenos, objetivando a clonagem fisica e posterior sequenciamento destes promotores.  \nO projeto e financiado pela FAPESP atraves do auxilio regular no 2019/12424-6 .","PeriodicalId":159299,"journal":{"name":"Anais do(a) Anais do Congresso Brasileiro Interdisciplinar em Ciência e Tecnologia","volume":"32 1","pages":"0"},"PeriodicalIF":0.0000,"publicationDate":"2021-07-05","publicationTypes":"Journal Article","fieldsOfStudy":null,"isOpenAccess":false,"openAccessPdf":"","citationCount":"0","resultStr":"{\"title\":\"PROSPECÇÃO E ANÁLISE IN SÍLICO DE NOVOS PROMOTORES CONSTITUTIVOS PARA CANA-DE-AÇÚCAR\",\"authors\":\"V. H. D. 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摘要

对新的可再生能源日益增长的需求和世界人口的增加使得植物生物技术对旨在开发转基因植物(gmo)的新研究至关重要。为了获得这些转基因生物,启动子在基因的调控和表达中发挥着重要作用。其中,构成性启动子负责调控基因,这些基因在植物发育的不同组织和阶段不间断地表达,主要参与细胞的基础代谢。虽然结构启动子的特征已经对一些植物生物起作用,但到目前为止,在禾草基因工程中缺乏强大的结构启动子,特别是在巴西第一代和第二代乙醇生产的主要原料甘蔗(Saccharum officinarum)中。摘要目的:本研究旨在评价和表征甘蔗的新型硅促进剂及其在高粱和玉米中的同源物,以开发新的高效禾草转化载体。材料和方法:从数据库genomicos和transcriptomicos,具体到甘蔗和其他相关的物种,除了bioinformatica工具旨在识别基因组成及其homologos视觉化的表达和候选人进行隔离他们的开发商找到价钱genicos进行的分析。部分结果:到目前为止,至少有可能鉴定出10个组成甘蔗的基因及其在玉米和高粱中的同源基因。在SuCEST中进行了北方虚拟表达试验,并在其同源库中进行了补充,拉伸因子1 Delta 1、FT SUI1同源蛋白和精氨酸tRNA连接酶基因的表达谱最好。与此同时,我们开始研究能够在禾草中驱动构成性表达的新的男性启动子。下一步是设计内源性启动子的特定引物,旨在物理克隆和随后对这些启动子进行测序。该项目由FAPESP通过2019/12424-6号常规援助资助。
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PROSPECÇÃO E ANÁLISE IN SÍLICO DE NOVOS PROMOTORES CONSTITUTIVOS PARA CANA-DE-AÇÚCAR
A crescente demanda por novas fontes renovaveis de geracao de energia e o aumento da populacao mundial tornam a Biotecnologia Vegetal indispensavel para novas pesquisas visando o desenvolvimento de plantas geneticamente modificadas (OGMs). Para a obtencao desses OGMs, os promotores exercem importante funcao na regulacao e expressao dos genes. Dentre eles, os promotores constitutivos sao responsaveis pela regulacao de genes cuja expressao ocorre ininterrupta nos diferentes tecidos e estagios de desenvolvimento da planta, sendo estes na maioria das vezes envolvidos com o metabolismo basal da celula. Apesar de promotores constitutivos ja caracterizados funcionarem para alguns organismos vegetais, ate o momento ha deficiencia de fortes promotores constitutivos para a engenharia genetica de gramineas, sobretudo na cana-de-acucar (Saccharum officinarum), principal materia-prima utilizada para producao de etanol de primeira e segunda geracao no Brasil. Objetivo: O presente estudo visa avaliar e caracterizar in silico novos promotores constitutivos da cana, bem como seus homologos em Sorgo e Milho, para o desenvolvimento de novos vetores de transformacao eficientes para gramineas. Materiais e metodos: A partir de banco de dados genomicos e transcriptomicos, especificos para a Cana e outras especies correlatas, alem de ferramentas de bioinformatica pretende-se identificar os genes constitutivos e seus homologos, visualizar a sua expressao e encontrar possiveis candidatos para isolar seus promotores genicos e realizar as analises. Resultados parciais: Ate o momento, foi possivel realizar a identificacao de ao menos 10 genes constitutivos da cana-de-acucar e seus homologos em milho e sorgo. Atraves dos testes de expressao de Northern virtual no SuCEST e de forma complementar, em bancos especificos para seus homologos, os genes Fator de Elongacao 1 Delta 1, Proteina Homologa ao FT SUI1 e Arginina tRNA Ligase da cana-de-acucar demonstraram os melhores perfis de expressao. Concomitantemente a isso, iniciamos estudos na prospeccao de novos promotores viriais capazes de conduzir a expressao constitutiva em gramineas.  A proxima etapa consiste em desenhar iniciadores especificos dos promotores endogenos, objetivando a clonagem fisica e posterior sequenciamento destes promotores.  O projeto e financiado pela FAPESP atraves do auxilio regular no 2019/12424-6 .
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