{"title":"基于多模态自编码器的特征集成预测药物分类码","authors":"Yi-Sue Jung, Jong-Hoon Park, Young-Rae Cho","doi":"10.5626/ktcp.2023.29.10.474","DOIUrl":null,"url":null,"abstract":"COVID-19와 같이 새롭게 등장한 질병에 신속히 효과적으로 대처하기 위하여 컴퓨터 알고리즘을 사용한 약물 재배치 기법이 주목받고 있다. 본 연구에서는 약물의 다양한 특성을 멀티모달 자동 인코더를 통해 통합하여 약물의 분류 체계인 ATC 코드를 예측하는 방법을 제안한다. 약물 간의 유사도는 약물의 화학 구조, 질병 또는 단백질과의 상관관계, 약물 간 상호작용, 약물 부작용 정보를 활용하여 계산하였고, 멀티모달 자동 인코더를 통해 이를 통합하여 하나의 약물 유사도 네트워크를 구성하였다. 또한, 약물-ATC 코드 이기종 네트워크를 구성하여 ATC 코드 예측을 진행하였다. 교차검증을 통해 실험 결과를 평가했을 때, 단일 유사도를 사용하는 경우 0.847의 AUC 값에서 병합된 유사도를 사용했을 때 0.914의 AUC 값으로 예측 정확도가 8.5% 향상되었다.","PeriodicalId":479646,"journal":{"name":"Jeongbogwahakoe keompyuting-ui silje nonmunji","volume":"37 4","pages":"0"},"PeriodicalIF":0.0000,"publicationDate":"2023-10-31","publicationTypes":"Journal Article","fieldsOfStudy":null,"isOpenAccess":false,"openAccessPdf":"","citationCount":"0","resultStr":"{\"title\":\"Predicting Drug Classification Codes by Feature Integration Using Multi-modal Autoencoders\",\"authors\":\"Yi-Sue Jung, Jong-Hoon Park, Young-Rae Cho\",\"doi\":\"10.5626/ktcp.2023.29.10.474\",\"DOIUrl\":null,\"url\":null,\"abstract\":\"COVID-19와 같이 새롭게 등장한 질병에 신속히 효과적으로 대처하기 위하여 컴퓨터 알고리즘을 사용한 약물 재배치 기법이 주목받고 있다. 본 연구에서는 약물의 다양한 특성을 멀티모달 자동 인코더를 통해 통합하여 약물의 분류 체계인 ATC 코드를 예측하는 방법을 제안한다. 약물 간의 유사도는 약물의 화학 구조, 질병 또는 단백질과의 상관관계, 약물 간 상호작용, 약물 부작용 정보를 활용하여 계산하였고, 멀티모달 자동 인코더를 통해 이를 통합하여 하나의 약물 유사도 네트워크를 구성하였다. 또한, 약물-ATC 코드 이기종 네트워크를 구성하여 ATC 코드 예측을 진행하였다. 교차검증을 통해 실험 결과를 평가했을 때, 단일 유사도를 사용하는 경우 0.847의 AUC 값에서 병합된 유사도를 사용했을 때 0.914의 AUC 값으로 예측 정확도가 8.5% 향상되었다.\",\"PeriodicalId\":479646,\"journal\":{\"name\":\"Jeongbogwahakoe keompyuting-ui silje nonmunji\",\"volume\":\"37 4\",\"pages\":\"0\"},\"PeriodicalIF\":0.0000,\"publicationDate\":\"2023-10-31\",\"publicationTypes\":\"Journal Article\",\"fieldsOfStudy\":null,\"isOpenAccess\":false,\"openAccessPdf\":\"\",\"citationCount\":\"0\",\"resultStr\":null,\"platform\":\"Semanticscholar\",\"paperid\":null,\"PeriodicalName\":\"Jeongbogwahakoe keompyuting-ui silje nonmunji\",\"FirstCategoryId\":\"1085\",\"ListUrlMain\":\"https://doi.org/10.5626/ktcp.2023.29.10.474\",\"RegionNum\":0,\"RegionCategory\":null,\"ArticlePicture\":[],\"TitleCN\":null,\"AbstractTextCN\":null,\"PMCID\":null,\"EPubDate\":\"\",\"PubModel\":\"\",\"JCR\":\"\",\"JCRName\":\"\",\"Score\":null,\"Total\":0}","platform":"Semanticscholar","paperid":null,"PeriodicalName":"Jeongbogwahakoe keompyuting-ui silje nonmunji","FirstCategoryId":"1085","ListUrlMain":"https://doi.org/10.5626/ktcp.2023.29.10.474","RegionNum":0,"RegionCategory":null,"ArticlePicture":[],"TitleCN":null,"AbstractTextCN":null,"PMCID":null,"EPubDate":"","PubModel":"","JCR":"","JCRName":"","Score":null,"Total":0}
Predicting Drug Classification Codes by Feature Integration Using Multi-modal Autoencoders
COVID-19와 같이 새롭게 등장한 질병에 신속히 효과적으로 대처하기 위하여 컴퓨터 알고리즘을 사용한 약물 재배치 기법이 주목받고 있다. 본 연구에서는 약물의 다양한 특성을 멀티모달 자동 인코더를 통해 통합하여 약물의 분류 체계인 ATC 코드를 예측하는 방법을 제안한다. 약물 간의 유사도는 약물의 화학 구조, 질병 또는 단백질과의 상관관계, 약물 간 상호작용, 약물 부작용 정보를 활용하여 계산하였고, 멀티모달 자동 인코더를 통해 이를 통합하여 하나의 약물 유사도 네트워크를 구성하였다. 또한, 약물-ATC 코드 이기종 네트워크를 구성하여 ATC 코드 예측을 진행하였다. 교차검증을 통해 실험 결과를 평가했을 때, 단일 유사도를 사용하는 경우 0.847의 AUC 값에서 병합된 유사도를 사용했을 때 0.914의 AUC 값으로 예측 정확도가 8.5% 향상되었다.