糖尿病小鼠模型中与骨骼肌萎缩相关的环状RNA

Lei Yang, Yun Wang, Fang Deng, Teng-Fei Xu, Deming Gou, Wei Zhou, Zhangli Hu, Xianghui Zou
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摘要

摘 要:骨骼肌萎缩是糖尿病患者中、晚期严重并发症之一,为研究其分子发病机制,利用链脲佐菌 素诱导构建小鼠 1型糖尿病模型,通过高通量测序技术,调查与糖尿病肌萎缩病变相关的环状核糖核酸 (circular ribonucleic acid,circRNA)表达谱,并利用生物信息分析软件探究 circRNA在糖尿病骨骼肌萎缩病 变中的可能作用.结果显示,与正常同基因背景小鼠的同类组织相比,糖尿病鼠的腓肠肌呈现:1肌纤维 面积明显减小,运动功能下降;2 含有 1 403个与 1型糖尿病发生发展相关的差异表达 circRNA,其中, 690个上调和713个下调;3通过基因本体、京都基因和基因组百科全书的功能富集分析显示,差异表达 的候选 circRNA亲本基因主要富集于转录调节生物学过程、细胞质成分和蛋白质结合分子功能等方面,以 及促分裂原活化蛋白激酶信号通路、泛素介导的蛋白降解、叉头盒蛋白O通路与糖尿病肌萎缩相关的信号 通路等.通过数据库信息和生物信息分析技术,预测与肌萎缩基因MuRF1相结合的小RNA(mirco RNA, miRNA),并挖掘出可调控它们表达的功能circRNA,构建了circRNA-miRNA-mRNA的潜在分子调控反应轴 和互作网络.研究结果表明,与肌萎缩相关的circRNA在糖尿病发病中具有调控关键分子的潜能.
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Circular RNAs related to skeletal muscle atrophy in diabetic mouse model
摘 要:骨骼肌萎缩是糖尿病患者中、晚期严重并发症之一,为研究其分子发病机制,利用链脲佐菌 素诱导构建小鼠 1型糖尿病模型,通过高通量测序技术,调查与糖尿病肌萎缩病变相关的环状核糖核酸 (circular ribonucleic acid,circRNA)表达谱,并利用生物信息分析软件探究 circRNA在糖尿病骨骼肌萎缩病 变中的可能作用.结果显示,与正常同基因背景小鼠的同类组织相比,糖尿病鼠的腓肠肌呈现:1肌纤维 面积明显减小,运动功能下降;2 含有 1 403个与 1型糖尿病发生发展相关的差异表达 circRNA,其中, 690个上调和713个下调;3通过基因本体、京都基因和基因组百科全书的功能富集分析显示,差异表达 的候选 circRNA亲本基因主要富集于转录调节生物学过程、细胞质成分和蛋白质结合分子功能等方面,以 及促分裂原活化蛋白激酶信号通路、泛素介导的蛋白降解、叉头盒蛋白O通路与糖尿病肌萎缩相关的信号 通路等.通过数据库信息和生物信息分析技术,预测与肌萎缩基因MuRF1相结合的小RNA(mirco RNA, miRNA),并挖掘出可调控它们表达的功能circRNA,构建了circRNA-miRNA-mRNA的潜在分子调控反应轴 和互作网络.研究结果表明,与肌萎缩相关的circRNA在糖尿病发病中具有调控关键分子的潜能.
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