安蒂奥基亚(哥伦比亚)马铃薯种子块茎中五种rna病毒的流行情况

Yuliana Marcela Gallo García, Andrea Sierra Mejía, P. G. Gutiérrez Sánchez, Mauricio Alejandro Marín Montoya
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摘要

马铃薯是哥伦比亚国内需求最大的农产品之一。这种作物受到一种降低块茎种子产量和质量的病毒复合物的影响。本文使用实时RT-PCR评估了五种RNA病毒(PVY、PVS、PVX、PLRV和PYVV)在商业和非商业块茎种子(TC)及其衍生植物芽中的患病率。结果表明,这五种病毒在种子材料中的感染水平很高,商业块茎中最多有四种病毒的混合感染。PVY(74%)和PVS(36%)在块茎种子植物中的患病率最高。PVY+PLRV组合在块茎-种子TC中的患病率最高(24%),而在TNC中,PVY+PYVV+PVS和PVY+PVS+PLRV组合出现在10%的样本中。检测到的病毒的系统发育亲和力通过对衣壳扩增子的桑格测序进行评估,并将其分为先前在哥伦比亚茄科植物上鉴定的亚基。这些结果表明,需要采取紧急行动,提高该国种植的马铃薯种子材料的病毒健康水平。
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Prevalencia de cinco virus de ARN en tubérculos-semilla de papa cultivados en Antioquia (Colombia)
La papa (Solanum tuberosum) es uno de los productos agrícolas con mayor demanda interna en Colombia. Este cultivo es afectado por un complejo de virus que reduce los rendimientos y la calidad de los tubérculos-semilla. En este trabajo se evaluó la prevalencia de cinco virus de ARN (PVY, PVS, PVX, PLRV y PYVV) en brotes de tubérculos-semilla de origen comercial (TC) y no-comercial (TNC) y en sus plantas derivadas, utilizando RT-PCR en tiempo real. Los resultados evidenciaron altos niveles de infección de los cinco virus en el material de siembra e infecciones mixtas hasta con cuatro virus en los tubérculos comerciales. PVY (74%) y PVS (36%) presentaron los mayores niveles de prevalencia en plantas derivadas de tubérculos-semilla. La combinación PVY+PLRV presentó el mayor nivel de prevalencia en tubérculos-semilla TC (24%), mientras que en TNC las combinaciones PVY+PYVV+PVS y PVY+PVS+PLRV se presentaron en 10% de las muestras. La afinidad filogenética de los virus detectados se evaluó mediante secuenciación Sanger de amplicones de cápside, agrupándose en subclados previamente identificados sobre solanáceas en Colombia. Estos resultados señalan la necesidad de tomar acciones urgentes que permitan mejorar los niveles de sanidad viral de los materiales de siembra de papa cultivados en el país.
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