用AFLP分析小豆(菜豆)的种群结构。

R. Ruíz-Salazar, N. Mayek-Pérez, M. L. P. Vargas-Vázquez, Sanjuana Hernández-Delgado, José S. Muruaga-Martínez
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摘要

Ayocote豆(菜豆L.;2n=2x=22)是一种原产于墨西哥高地的豆类,对人类消费和获得改良特性具有重要意义,对病原体和某些非生物因素(低温耐受性)具有抵抗力。本研究的目的是确定与墨西哥普埃布拉州Carso Huasteco 15个地点相对应的117个瓢虫种群结构,加上5个目击者,以通过扩增片段长度多态性(AFLP)技术了解瓢虫克里奥尔材料中存在的多样性程度。人口结构(Delta K)的值估计为3。多态性为87.4%,AMOVA表明采集者之间存在中度遗传分化(F st=0.067),群体之间和群体内部解释的方差为6.7%和93.3%。多样性指数(ID)最高的是Zacapoaxtla(56.8%)和Ahuacalan(50.5%)的市场收藏品;奇格纳瓦潘的种质ID最低(39.6%)。根据AFLP数据进行的聚类分析没有显示基于收集来源定义的聚类。这可能是由于该物种的异源交配(14.7%)和当地市场的种子贸易。
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ANÁLISIS DE LA ESTRUCTURA POBLACIONAL DEL FRIJOL AYOCOTE (Phaseolus coccineus L.) MEDIANTE AFLP.
El frijol ayocote ( Phaseolus coccineus L.; 2n=2x=22 ) es una leguminosa originaria de las zonas altas de Mexico, tiene importancia para consumo humano y obtencion de caracteristicas de mejoramiento, muestra resistencia a patogenos y a ciertos factores abioticos (tolerancia a bajas temperaturas). El objetivo del presente estudio fue determinar la estructura poblacional de 117 colectas de P. coccineus correspondientes a 15 localidades del Carso Huasteco del estado de Puebla, Mexico, mas cinco testigos para conocer el grado de diversidad existente en los materiales criollos de P. coccineus mediante la tecnica de polimorfismos en longitud de fragmentos amplificados (AFLP). Se estimo el valor de la estructura poblacional (delta K) el cual fue igual a 3. El polimorfismo presentado fue 87.4 % y el AMOVA indico moderada diferenciacion genetica entre las recolectas (F ST = 0.067), la varianza explicada entre y dentro de poblaciones fue 6.7 y 93.3 %. El indice de diversidad (ID) mayor correspondieron a las recolectas del Mercado de Zacapoaxtla (56.8 %) y Ahuacatlan (50.5 %); el germoplasma de Chignahuapan presento el menor ID (39.6 %). El analisis de conglomerados, a partir de datos AFLP, no mostro agrupamientos definidos basados en el origen de recolecta. Esto podria deberse a la alogamia de la especie (14.7 %) y el comercio de semilla en mercados locales.
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