白鲸和燕鸥AhR和TCDD特异性相互作用的片段MO计算

Satoshi Miyagi, Eri Yoshikawa, Kenichi Dedachi, S. Itoh, M. Ishihara-Sugano, N. Kurita
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摘要

芳香族碳氢化合物受体(AhRArylhydrocarbon receptor)在内分泌扰乱物质等外来异物进入生物体内时,将其结合,并将其信息传递给细胞核,诱导代谢酶的出现。但是,AhR的立体结构以及AhR与外来异物的相互作用机制尚不明确。为了弄清这一机制,本研究将研究白海豚和燕鸥的AhR,以及代表性的内分泌扰乱物质二恶英(TCDD)。2、3、7、8-tetrachrodibenzo-p-dioxin)的复合物结构,通过利用经典分子力学法和Fragment分子轨道法的分子模拟,将其特异性相互作用转化为原子、电在子层面进行了解析。结果表明,两种AhR中第42个氨基酸的差异对AhR和TCDD之间的相互作用产生了重大影响,白海豚的AhR与燕鸥的AhR结合TCDD的强度更大。这个结果定性地说明了白海豚对TCDD的感受性更高的实验结果。
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Fragment MO Calculations on Specific Interactions between AhR and TCDD for Beluga and Tern
芳香族炭化水素受容体(AhR: Arylhydrocarbon receptor)は、内分泌撹乱物質等の外来異物が生体内に取り込まれた時に、これらを結合し、その情報を核に伝え、代謝酵素の発現を誘導することが明らかになっている。しかし、AhRの立体構造及びAhRと外来異物との相互作用機構は未解明である。本研究では、この機構を解明するため、シロイルカ及びアジサシのAhRと、代表的な内分泌撹乱物質であるダイオキシン(TCDD: 2,3,7,8-tetrachrodibenzo-p-dioxin)の複合体構造を作成し、その特異的相互作用を、古典分子力学法及びFragment分子軌道法を用いた分子シミュレーションにより、原子・電子レベルで解析した。その結果、2種類のAhR中の42番目のアミノ酸の相違が、AhRとTCDD間の相互作用に大きな影響を与え、シロイルカのAhRがアジサシのAhRよりも強くTCDDを結合することが明らかになった。この結果は、シロイルカの方がTCDDに対し感受性が高いとする実験結果を定性的に説明出来る。
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Journal of Computer Aided Chemistry
Journal of Computer Aided Chemistry CHEMISTRY, MULTIDISCIPLINARY-
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