强大的集成工具,结合结构生成器和化学空间可视化

K. Hasegawa, K. Funatsu
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摘要

本研究介绍了药物设计的两种基本方法。即结构发生和化学结构图示化。结构发生在读取优化中被利用,并且对于结构跳跃是有用的。我们关注基于定量结构活性相关性的结构发生。也就是逆定量的结构活性相关方法。逆定量结构活性相关方法的目的是从定量结构活性相关模型中提出具有较高生物活性的预测化学结构。化学结构图示化是读取优化的另一重要方法。化学结构图示化是指示合成化合物在化学空间上存在的位置或合成到什么程度才能实现裂缝优化的良好的指南针。图示也有助于理解对多个目标蛋白质的分子选择性。一般来说,化合物对多个目标蛋白质表现出生物活性可能会引起不期望的副作用,因此化学结构图示化在安全性方面也非常有价值。包括我们的研究在内,对结构发生和化学结构图示化的两种基本方法分别进行简单的总结。
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Powerful Integrative Tool Combining Structure Generator and Chemical Space Visualization
本研究では、薬物設計における2つの基本的な手法を紹介する。すなわち、構造発生と化学構造図示化である。構造発生は、リード最適化で利用され、構造ホッピングに有用である。我々は、定量的構造活性相関に基づく構造発生に注目する。すなわち、逆定量的構造活性相関手法である。逆定量的構造活性相関手法の目的は、定量的構造活性相関モデルから生物活性が高いと予測される化学構造を提案することである。化学構造図示化は、リード最適化の別の重要な手法である。化学構造図示化は、合成化合物が化学空間上どこに存在しているかということ、あるいは、どこまで合成を行えばリード最適化が達成できるかを示す良いコンパスとなる。図示化は、複数のターゲットタンパク質に対する分子選択性を理解するのにも役立つ。一般に、化合物が複数のターゲットタンパク質に対して生物活性を示すと望ましくない副作用を引き起こす可能性があるので、化学構造図示化は安全性の面からも非常に価値がある。われわれの研究を含めて、2つの基本的な手法である構造発生と化学構造図示化を、それぞれ簡単に総説する。
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Journal of Computer Aided Chemistry
Journal of Computer Aided Chemistry CHEMISTRY, MULTIDISCIPLINARY-
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A method to search the most stable reaction pathway and its application to the Pinner Pyrimidine Synthesis reaction Extended Regression Modeling of the Toxicity of Phenol Derivatives to Tetrahymena pyriformis Using the Electronic-Structure Informatics Descriptor Solvatochromism of 4-(diethylamino)-4’-nitroazobenzene: explanation based on CNDO/S calculation results Prediction of Compound Cytotoxicity Based on Compound Structures and Cell Line Molecular Characteristics [Special Issue for Honor Award dedicating to Prof Kimito Funatsu]Kimito Funatsu – Driving Force of Japanese-French Collaboration in Chemoinformatics
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GB/T 7714-2015
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