过氧化物酶体增殖物激活受体PPAR与增塑剂特异性相互作用的分子力学和分子轨道模拟

Shingo Iwabuchi, Tomohiko Nakagawa, Haruhiko Nakamura, Yoko Yamaguchi, Tamie Nasu, N. Kurita
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摘要

过氧细胞增殖剂激活受体(Peroxisome proliferator-activated receptor)PPAR)是一种配体依赖性转录因子,最近的医学研究表明,它与许多疾病有关。另外,作为塑料类的增塑剂使用的邻苯二甲酸二-2-乙基己酯(DEHP)等邻苯二甲酸酯类,根据生理医学的研究,可以诱导PPAR,发挥各种毒性。本研究旨在从原子和电子层面揭示PPAR的子类型PPARα与塑化剂的特异性相互作用机制,以确保PPARα与邻苯二甲酸酯和叠氮平酸酯的复合物的稳定。利用古典分子力场AMBER确定了结构。另外,针对稳定结构,使用半经验分子轨道法MOPAC计算电子状态。以这些结果为基础,分析PPARα与邻苯二甲酸酯和叠氮平酸酯的结合特性,并与小鼠实验结果进行比较。
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Molecular Mechanics and Molecular Orbital Simulations on Specific Interactions between Peroxisome Proliferator-Activated Receptor PPAR and Plasticizers
ペルオキシゾーム増殖剤活性化受容体(Peroxisome proliferator-activated receptor : PPAR)は、リガンド依存的転写因子であり、最近の医学的研究により、多くの病気に関与することが明らかになっている。また、プラスチック類の可塑剤として使用されるフタル酸ジ-2-エチルヘキシル(DEHP)などのフタル酸エステル類は、PPARを誘導し、様々な毒性を発揮することが生理医学的研究により分かっている。本研究では、PPARのサブタイプであるPPARαとプラスチック可塑剤の特異的相互作用機構を原子・電子レベルで解明することを目的とし、PPARαとフタル酸エステル類及びアジピン酸エステルとの複合体の安定構造を、古典分子力場AMBERを用いて求めた。また、安定構造に対し、半経験的分子軌道法MOPACを用いて電子状態を計算した。これらの結果を基に、PPARαとフタル酸エステル類及びアジピン酸エステルの結合特性を解析し、マウスを用いた実験結果と比較した。
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Journal of Computer Aided Chemistry
Journal of Computer Aided Chemistry CHEMISTRY, MULTIDISCIPLINARY-
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