Análisis filogenético de aislamientos patogénicos de la familia botryosphaeriaceae en cacao (Theobroma cacao L.) en la zona de Los Ríos

Los problemas fitosanitarios causados por hongos vasculares que afectan a las plantaciones de cacao CCN-51, han tomado gran importancia en las últimas décadas, por los daños que le producen. Especies de la familia Botryosphaeriaceae están asociadas a cancros y secamiento de yemas, muerte descendente, pudrición de frutos y pudrición del cuello, síntomas que se han observados en diferentes zonas y que merman la producción de la planta. Con el objetivo de caracterizar e identificar a nivel molecular aislamientos patogénicos de este hongo, se muestrearon cinco árboles sintomáticos seleccionados de fincas localizadas los cantones: Buena Fe, Mocache, Quevedo, Quinsaloma y Valencia de la provincia de Los Ríos, obteniendo 15 aislamientos de los cuales se extrajo ADN y utilizaron secuencias de las regiones de ITS (Internal transcribed spacer) y EF1-a (Factor de elongación de alpha). Los tamaños de secuencia se verificaron mediante electroforesis y se establecieron las identidades putativas de 3 especies utilizando la herramienta de Basic local aligment (BLAST). Los árboles filogenéticos construidos mediante los algoritmos de máxima verosimilitud y vecinos cercanos, con los aislamientos en cinco cantones, confirmaron la presencia de Lasiodiplodia theobromae en Quevedo, Diplodia seriata en Quinsaloma y Botryosphaeria dothidea en Valencia, Mocache y Buena Fe, resaltando una politomía entre estos últimos.