Génomique des canards

La democratisation des outils de la genomique et plus particulierement du sequencage a haut debit a permis le sequencage du genome du canard commun. Des projets complementaires sont deja inities pour prolonger et exploiter au mieux ces premiers acquis. En tout premier lieu, il s’agit de poursuivre la description de la structure du genome et d’en exploiter les connaissances : cartes d’hybrides irradies pour ordonner la sequence le long des chromosomes ; genomique comparee avec le genome de la poule pour beneficier des connaissances sur ce genome modele ; recherche de SNP (Single Nucleotide Polymorphism) pour les etudes et la gestion de populations ; carte genetique pour la detection des QTL (Quantitative Trait Locus). La premiere detection de QTL influencant les performances du mulard, realisee a l’aide de marqueurs microsatellites chez la cane commune, sera completee par une seconde etude utilisant des marqueurs SNP developpes specifiquement et permettant une bien meilleure couverture du genome. Par ailleurs, il est important de realiser une annotation fonctionnelle du genome, ce qui peut etre aborde par le sequencage de transcrits. A terme, le genome annote sera utilise pour analyser son expression dans differents tissus et/ou conditions d’elevage, la connaissance des modeles de transcrits et de proteines facilitant les etudes en transcriptomique et proteomique. Le canard mulard, produit du croisement de la cane commune avec le canard de Barbarie, devra egalement etre etudie en raison de son interet agronomique, lie a ses performances exceptionnelles dans la filiere des palmipedes gras.