土耳其水域大西洋马鲛鱼(Trachurus Trachurus)的遗传变异。

IF 0.6 4区 生物学 Q4 MARINE & FRESHWATER BIOLOGY Cahiers De Biologie Marine Pub Date : 2009-01-01 DOI:10.5072/ZENODO.52736
C. Turan, B. Öztürk, M. Caliskan, Ertuğ Düzgüneş, Mevlüt Gürlek, D. Yağlioğlu, D. Hazar, Sibel Sevenler
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摘要

土耳其水域鲭鱼(Trachurus Trachurus)的遗传变异。以线粒体基因16S rDNA为基础,对黑海、马尔马拉、爱琴海和地中海东北部8个监测站的气管进行了地理变异研究。RFLP分析显示,307个个体中有14个单倍型。单倍型群体的分布主要遵循人口的地理起源。种群内平均单倍型多样性较高(0.7311),核苷酸多样性较低(0.0071)。样品间平均低核苷酸散度为0.00271。黑海西部和东部样品的核苷酸散度最高(0.01119),地中海东北部两个样品的核苷酸散度最低(- 0.0018)。用蒙特卡罗方法检测了单倍型频率不同的种群。单倍型的分布和核苷酸差异的估计表明,黑海种群(BS2)存在显著差异。Mantel检验表明,这些种群之间的遗传差异与它们的地理距离无关(r = 0.326;P > 0.05)。
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Genetic variation of Atlantic horse mackerel (Trachurus trachurus) in the Turkish waters.
Variation genetique du chinchard (Trachurus trachurus) dans les eaux turques. Les variations geographiques de Trachurus trachurus basees sur le gene mitochondrial 16S rDNA a 8 stations, incluant les Mer Noire, Marmara, Egee et le nord-est de la Mer Mediterranee ont ete recherchees. Les analyses RFLP revelent 14 haplotypes chez les 307 individus des differentes populations. La repartition des groupes haplotypiques suit la plupart du temps l'origine geographique des populations. La diversite haplotypique moyenne au sein des populations est elevee (0,7311) et la diversite nucleotidique faible (0,0071). La faible divergence nucleotidique moyenne entre les echantillons est de 0,00271. La plus forte valeur de divergence nucleotidique a ete detectee entre les echantillons de Mer Noire occidentale et orientale (0,01119) et la plus faible (-0,00018) entre les deux echantillons du nord-est de la Mediterranee. Des populations differant par leurs frequences haplotypiques ont ete detectees par la methode de Monte Carlo. La distribution des haplotypes et l'estimation de la divergence nucleotidique met en evidence une forte differenciation de la population de Mer Noire (BS2). Le test de Mantel montre que les differences genetiques entre ces populations ne sont pas correlees a leurs distances geographiques (r = 0,326; P > 0,05).
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Cahiers De Biologie Marine
Cahiers De Biologie Marine 生物-海洋与淡水生物学
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期刊介绍: BM - Cahiers de Biologie Marine publishes papers on all aspects of the biology of marine organisms and of biological oceanography, in particular in the following fields: Benthic and planktonic Ecology; Ecophysiology; Population dynamics and Population genetics; Food webs; Systematics and Phylogeny. The key criteria are that the work clearly demonstrates its novelty, its importance to a particular field as well as its interest to those outside that discipline, and conclusions that are justified by the study. Reviews on current topics are welcome. Selected papers or abstracts from international symposia or workshops may also be considered. Short communications (4 printed pages) may also be published. Papers must be original and must not have been published or be under consideration for publication elsewhere. They will be reviewed by at least two referees before acceptance for publication. Short note about new record could be accepted only if this one significantly increases the distribution area of the species and if the paper includes a discussion about the general distribution of the species and the significance of the observed range extension.
期刊最新文献
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