首页 > 农学

JIPB | 河南大学张学斌团队开发植物代谢组学数据分析流程:MetMiner

JIPB 2024-09-11 09:59
文章摘要
河南大学张学斌团队开发了一款名为MetMiner的用户友好型大规模植物代谢组学数据分析流程。该流程基于R-shiny开发,具有交互性强的图形界面,适用于处理大样本量的代谢组学数据。MetMiner由三部分组成:上游数据处理、下游数据分析和进阶数据挖掘。上游数据处理通过tidyMass框架确保数据分析的透明性和可重复性;下游数据分析包括代谢物的注释、分类和富集分析;进阶数据挖掘通过迭代WGCNA策略构建代谢物共积累网络。研究还通过实际案例展示了MetMiner在群体规模代谢组学数据挖掘中的准确性和高效性。
JIPB | 河南大学张学斌团队开发植物代谢组学数据分析流程:MetMiner
本站注明稿件来源为其他媒体的文/图等稿件均为转载稿,本站转载出于非商业性的教育和科研之目的,并不意味着赞同其观点或证实其内容的真实性。如转载稿涉及版权等问题,请作者速来电或来函联系。
最新文章
JIPB | 南京农业大学植物保护学院作物疫病团队揭示晚疫病抗病基因聚合介导马铃薯广谱抗性发生的机制
JIPB | 南京农业大学植物保护学院作物疫病团队揭示晚疫病抗病基因聚合介导马铃薯广谱抗性发生的机制
马铃薯是我国继小麦、水稻和玉米后第四大主粮作物,而晚疫病是马铃薯生产上的一种毁灭性病害,贯穿整个生育期,一旦发病便导致马铃薯绝收。由于病原菌田间变异快,新的生理小种不断出现,短时间内就能克服单个抗病基
18小时前
JIPB 特约综述 | 华中农业大学李霞团队和昆士兰大学Peter M. Gresshoff团队联合综述大豆结瘤自调控研究新进展
JIPB 特约综述 | 华中农业大学李霞团队和昆士兰大学Peter M. Gresshoff团队联合综述大豆结瘤自调控研究新进展
大豆能够与土壤中的根瘤菌建立共生关系,通过固氮作用将大气中的氮气转化为可供自身利用的形式。研究表明,在大豆的生长发育阶段,超过60%的氮素需求依赖于共生固氮。然而,固氮作用是一个高能耗过程,过量结瘤会
2025-03-27
JIPB | 江苏省农科院植保所联合贵州大学揭示了OsPRMT5通过甲基化OsPAL1调控水稻抗白叶枯病的机制
JIPB | 江苏省农科院植保所联合贵州大学揭示了OsPRMT5通过甲基化OsPAL1调控水稻抗白叶枯病的机制
近日,JIPB在线发表了江苏省农科院植保所和贵州大学绿色农药全国重点实验室/农学院刘凤权教授团队题为“OsPRMT5 Methylates OsPAL1 to Promote Rice Resista
2025-03-26
JIPB | 北京市农林科学院赵久然/王凤格团队系统阐述我国玉米种质资源群体分化基因组特征和群体间遗传改良规律
JIPB | 北京市农林科学院赵久然/王凤格团队系统阐述我国玉米种质资源群体分化基因组特征和群体间遗传改良规律
玉米经过漫长的驯化过程,保留了其野生祖先的大部分多样性,形成了在表型和基因型水平上具有丰富遗传多样性的种质资源 (Brunner et al., 2005; Yamasaki et al., 2007
2025-03-25
Book学术官方微信
Book学术文献互助
Book学术文献互助群
群 号:481959085
Book学术
文献互助 智能选刊 最新文献 互助须知 联系我们:info@booksci.cn
Book学术提供免费学术资源搜索服务,方便国内外学者检索中英文文献。致力于提供最便捷和优质的服务体验。
Copyright © 2023 Book学术 All rights reserved.
ghs 京公网安备 11010802042870号 京ICP备2023020795号-1