首页 > 医学

Adv Sci丨基于多组学与机器学习的枯草芽孢杆菌全基因组代谢模型优化基因表达与细胞生长预测

BioArtMED 2024-09-29 14:30
文章摘要
该研究由江南大学刘龙教授课题组完成,发表于Advanced Science,旨在通过多组学数据和机器学习技术优化枯草芽孢杆菌的全基因组代谢模型,以提高基因表达和细胞生长预测的准确性。研究团队首先建立了枯草芽孢杆菌的标准化数据库,涵盖基因表达、转录调控、信号转导等多个方面。随后,构建了iBsu1209-ME模型,并设计了34个机器学习模型进行优化,最终通过EM_iBsu1209-ME模型实现了对细胞生长速率的高精度预测,预测准确率提高了46.7%。该研究不仅为枯草芽孢杆菌的基因型-表型关系研究提供了新的工具,也为其他微生物的数据挖掘和模型开发提供了技术参考。
Adv Sci丨基于多组学与机器学习的枯草芽孢杆菌全基因组代谢模型优化基因表达与细胞生长预测
本站注明稿件来源为其他媒体的文/图等稿件均为转载稿,本站转载出于非商业性的教育和科研之目的,并不意味着赞同其观点或证实其内容的真实性。如转载稿涉及版权等问题,请作者速来电或来函联系。
推荐文献
Issue Editorial Masthead
DOI: 10.1021/aev008i023_2014421 Pub Date : 2025-12-08
IF 5.5 3区 材料科学 Q2
Issue Editorial Masthead
DOI: 10.1021/elv007i023_2014833 Pub Date : 2025-12-09
IF 4.7 3区 材料科学 Q1
最新文章
Cell Genomics | 黄海亮等发现囊性纤维化易感突变竟能“反向保护”肠道
Cell Genomics | 黄海亮等发现囊性纤维化易感突变竟能“反向保护”肠道
炎症性肠病(Inflammatory Bowel Disease,IBD)是一类以慢性肠道炎症为特征的复杂疾病,包括克罗恩病和溃疡性结肠炎两大主要类型。其病因至今仍未完全明确,但遗传因素被视为重要驱动
10小时前
Nat Commun丨刘铭汉团队开发纳米酶功能化智能水凝胶通过打破“ROS-铁死亡-炎症”恶性循环促进椎间盘修复
Nat Commun丨刘铭汉团队开发纳米酶功能化智能水凝胶通过打破“ROS-铁死亡-炎症”恶性循环促进椎间盘修复
近日,Nature Communications 在线发表了来自陆军军医大学新桥医院刘铭汉教授团队完成的研究工作,题为Targeting the ROS-ferroptosis-inflammatio
10小时前
Cell | 707种药物筛选揭示肠道菌群重构核心机制,营养竞争是关键
Cell | 707种药物筛选揭示肠道菌群重构核心机制,营养竞争是关键
撰文|617肠道菌群作为人体“第二基因组”,其稳态平衡与宿主健康息息相关。研究发现,抗生素和非抗生素药物都可能引发肠道菌群失调,进而导致感染风险升高等一系列问题。然而,孤立菌株的药敏实验始终无法解释群
10小时前
NPJ Parkinson’s Dis丨刘军/范雨团队大规模外显子组测序发现六个帕金森病新候选风险基因
NPJ Parkinson’s Dis丨刘军/范雨团队大规模外显子组测序发现六个帕金森病新候选风险基因
帕金森病(Parkinson’s Disease, PD)是一种复杂的神经退行性疾病,其发病机制涉及遗传、环境和衰老等多重因素的相互作用。尽管全基因组关联研究(GWAS)已识别出许多常见的风险位点,但
10小时前
Book学术官方微信
Book学术文献互助
Book学术文献互助群
群 号:604180095
Book学术
文献互助 智能选刊 最新文献 互助须知 联系我们:info@booksci.cn
Book学术提供免费学术资源搜索服务,方便国内外学者检索中英文文献。致力于提供最便捷和优质的服务体验。
Copyright © 2023 Book学术 All rights reserved.
ghs 京公网安备 11010802042870号 京ICP备2023020795号-1