Cell｜樊荣团队开发全球首个临床级FFPE样本空间全转录组测序技术

本文介绍了耶鲁大学樊荣团队开发的全球首个临床级FFPE样本空间全转录组测序技术——Patho-DBiT。该技术能够对福尔马林固定石蜡包埋（FFPE）组织中的RNA分子进行空间分析，克服了FFPE样本RNA高度片段化和降解的挑战。Patho-DBiT通过微流控条形码标记和算法创新，实现了对临床存档FFPE组织的全覆盖、逐碱基的空间全转录组测序，能够精确解码FFPE复杂组织中丰富的RNA生物学信息，包括单细胞级mRNA图谱、非编码RNA表达、可变剪接、遗传变异等。该技术在不同组织类型和空间分辨率下进行了充分验证，展示了其在临床和研究中的广泛应用潜力，被认为是对空间组学领域的重要且及时的贡献。