文献分享 ｜Nature Methods｜scEpiChem同时检测单细胞小分子药物靶标结合和表观遗传图谱

本文介绍了一种名为scEpiChem的新技术，该技术能够同时检测单细胞水平上的小分子药物靶标结合和表观遗传图谱。研究者通过生物素化小分子与抗生物素抗体的结合，利用带有barcode的protein A-Tn5转座酶介导标记过程，实现了对单细胞内特定基因组区域的选择性分析。该方法在人类结直肠癌(CRC)类器官中展示了三种小分子与组蛋白修饰、染色质可及性或靶蛋白的单细胞共测定，揭示了异质CRC类器官内染色质状态背景下的多种药物相互作用。此外，研究还揭示了CRC类器官中小分子药物治疗后跨细胞类型的药物基因组结合动力学和自适应表观基因组。该技术的开发对于理解靶向基因组或表观基因组的抗癌小分子的细胞反应和耐药机制具有重要意义，为个性化治疗提供了新的视角。