Nat Biotechnol｜Baker团队：利用序列空间扩散模型设计多状态和功能蛋白质

华盛顿大学David Baker团队开发了一种基于RoseTTAFold的序列空间扩散模型ProteinGenerator，用于生成符合特定性质和功能需求的新型蛋白质。该模型通过在高维连续序列空间中进行扩散，结合RoseTTAFold预测的三维结构信息，能够高效地生成蛋白质序列和结构。研究团队通过该模型成功设计了富含稀有氨基酸、重复蛋白、生物活性肽笼以及多状态蛋白质，展示了模型在蛋白质设计领域的广泛应用前景。ProteinGenerator的高效性、灵活性和可扩展性为药物设计、生物传感器开发及定向进化实验提供了新的工具和方法。