J.AM.Soc.Mass.Spec.|靶向肽段匹配用于提升Top-Down序列覆盖
李惠琳课题组
2024-11-08 15:20
文章摘要
本文介绍了在Journal of the American Society for Mass Spectrometry上发表的一篇文章,探讨了通过靶向片段匹配来提升自上而下质谱法(TDMS)的序列覆盖率。文章提出了一种基于同位素拟合的谱图匹配软件,通过比较候选蛋白质形式的理论同位素分布与实验谱图,避免了传统去卷积方法的缺陷。研究结果表明,同位素拟合方法能够显著提高序列覆盖率,特别是在检测大碎片和内部重链区域时。通过对27,000张碎裂谱图的分析,作者发现同位素拟合方法在增加序列覆盖率的同时,并未显著增加错误发现率(FDR)。此外,该方法还展示了在高通量分析中的潜力,有助于更好地定义生物治疗药物的蛋白质形态。
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