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文献分享｜Cell｜福尔马林固定石蜡包埋组织的空间RNA分析

杨朝勇课题组 2024-11-15 09:00
文章摘要
本文介绍了一种名为Patho-DBiT的新技术，专门用于分析福尔马林固定石蜡包埋（FFPE）组织中的空间RNA。该技术结合了原位多聚腺苷酸化处理、微流控辅助的原位组织编码和计算创新，能够对FFPE样本中的RNA进行高灵敏度的全转录组测序。Patho-DBiT不仅能够检测基因表达和RNA处理的空间分布，还能揭示区域特异性剪接异构体和RNA编辑，为病理组织学研究提供了新的工具。文章还展示了Patho-DBiT在临床存档的FFPE样本中的应用，包括对小鼠胚胎、小鼠大脑和人类淋巴瘤组织的空间转录组分析，证明了其在解析复杂组织中RNA生物学全貌的潜力。
文献分享｜Cell｜福尔马林固定石蜡包埋组织的空间RNA分析
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