CJPS| 全原子分子动力学模拟：解锁纳米孔测序准确性提升新路径

纳米孔测序技术是一种创新的生物分子测序方法，具有快速、经济和高分辨率的优势。广东工业大学轻工化工学院丁明明教授课题组采用全原子分子动力学（MD）模拟方法，研究了带电石墨烯纳米孔中电渗流调控单链DNA（ssDNA）的序列识别。研究发现，石墨烯表面的电荷密度显著影响ssDNA的吸附和转运速度，高负电荷密度会显著减缓ssDNA转运速度，这突出了流体动力学效应和静电排斥的重要性。此外，表面电荷密度与导电性之间存在直接相关关系，随着表面电荷密度增加，离子导电性增强，这有助于提升信号强度并降低噪声水平，从而提升测序精确度。研究还揭示了ssDNA在不同表面电荷密度下表现出不同的转运行为，高负电荷密度下ssDNA的转运速度显著降低，这有助于提高测序精度。