Nature Genetics | 植物中特有的顺式调控序列及其功能特性研究

本研究在Nature Genetics上发表的文章探讨了植物中特有的顺式调控序列及其功能特性，特别是TSS（转录起始位点）下游区域的调控作用。通过拟南芥1001基因组计划的基因型和转录组数据进行eQTL分析，研究发现TSS下游区域存在显著的eQTL富集，这些eQTL与转录调控相关。进一步的大规模平行报告基因实验（MPRA）在拟南芥、番茄、玉米和烟草四个物种中验证了这一发现，揭示了TSS下游序列在基因表达调控中的重要性。研究还发现，GATC基序在TSS下游区域对基因表达有显著增强作用，且这种效应在不同物种和组织中具有保守性。这些发现为理解植物基因表达调控提供了新的视角，并为进一步研究植物转录调控网络奠定了基础。