Nat Commun | 中国科大瞿昆团队实现染色体外环状DNA检测方法的系统性评估

中国科学技术大学瞿昆教授课题组在Nature Communications期刊上发表了一项关于染色体外环状DNA（eccDNA）检测方法的系统性评估研究。该研究评估了7种分析算法和7种实验建库方法在检测eccDNA中的性能和差异。eccDNA在肿瘤细胞中具有重要作用，参与癌基因扩增和肿瘤异质性，因此其准确检测对理解肿瘤发病机制和开发靶向药物至关重要。研究结果显示，Circle-Map和Circle_finder在短读长测序数据中表现优异，而CReSIL在长读长测序数据中表现最佳。此外，Circle-Seq-LR特别适用于检测与肿瘤进展相关的eccDNA。该研究还提供了完整的分析流程和模拟数据集，以帮助研究人员选择最优的分析方法。