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Adv Sci丨李向涛团队使用双图对比学习为空间转录组学提供准确的空间异质性解析和基因调控解释

BioArtMED 2024-12-04 14:30

文章摘要

李向涛团队在Advanced Science杂志上发表了一项研究，提出了stDCL（双图对比学习）方法，用于空间转录组学数据的准确空间异质性解析和基因调控解释。该方法通过整合基因表达数据和空间信息，使用图嵌入自动编码器和双图对比学习来训练模型，确保潜在嵌入表示与实际空间分布相似。研究结果表明，stDCL在多个数据集上表现优异，能够有效识别复杂空间域和组织结构，揭示分子和空间异质性，以及阐明疾病调控机制。该研究为空间转录组学提供了新的分析工具，有助于深入理解组织微环境中的生物学机制。

Adv Sci丨李向涛团队使用双图对比学习为空间转录组学提供准确的空间异质性解析和基因调控解释

查看文献： Accurate Spatial Heterogeneity Dissection and Gene Regulation Interpretation for Spatial Transcriptomics using Dual Graph Contrastive Learning.
查看期刊：Advanced Science

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