文献分享 ｜Science｜跨物种小脑皮层单细胞空间转录组图谱

本文介绍了一项发表在Science上的研究，题为“Cross-species single-cell spatial transcriptomic atlases of the cerebellar cortex”。研究团队开发了一种名为STitch3D的深度学习方法，用于整合多张空间转录组切片以重建组织的三维结构。该研究利用高分辨率的空间转录组技术Stereo-seq，绘制了猕猴、狨猴和小鼠的全小脑皮层覆盖的空间基因表达谱，揭示了啮齿类动物和灵长类动物之间的相似性和差异性。研究还发现了灵长类特异性细胞亚型，包括浦肯野细胞和分子层中间神经元，这些亚型有着不同的谷氨酸离子型受体基因的表达。此外，研究团队还收集了三个物种清醒状态下的静息态fMRI数据，将三维基因表达谱与小脑功能连接的梯度变化进行对应比较。这些发现为小脑进化和功能研究提供了宝贵的知识，并为未来研究小脑功能和疾病提供了重要的资源。