bioRxiv｜微软研究院推出蛋白质平衡态构象生成的大模型

微软研究院的Frank Noe团队在bioRxiv上发布了一篇关于使用生成深度学习模型Scalable emulation of protein equilibrium ensembles的文章。该研究旨在解决蛋白质功能预测中的采样问题，通过开发名为Biomolecular Emulator（BioEmu）的大模型，利用AlphaFold的evoformer蛋白质序列表示和扩散模型从平衡态集合中采样三维结构。研究结果表明，BioEmu在定性和定量评估中均表现出色，能够高效且准确地预测蛋白质的平衡态结构，显著降低了计算成本。此外，该模型在处理无结构实验数据方面也展示了高效性，通过属性预测微调（PPFT）方法实现了对实验数据的有效利用。总体而言，这项研究为蛋白质科学领域带来了革命性的进展，特别是在提高预测精度和降低计算成本方面。