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Genome Biol丨资治科、李立开发人机交互框架提升染色质拓扑相关结构域识别能力，助力三维基因组研究

BioArtMED 2024-12-19 14:30
文章摘要
在哺乳动物细胞核中，染色体通过复杂的折叠形成三维基因组结构，其中拓扑相关结构域（TADs）是其关键特征之一。然而，精准检测TAD仍然是一个挑战。中国科学院深圳先进技术研究院资治科研究员团队与华中农业大学李立教授团队合作，开发了一种基于“人机交互”框架的TAD识别方法，命名为HTAD。该方法通过结合主动学习和人工判断力，显著提升了机器学习模型的性能，解决了现有方法在局部结构识别上的一致性与可靠性问题。HTAD在TAD边界定位和复杂结构识别方面表现出色，为三维基因组结构的研究提供了新工具，提升了分析的准确性和可靠性。
Genome Biol丨资治科、李立开发人机交互框架提升染色质拓扑相关结构域识别能力，助力三维基因组研究
查看文献： HTAD: a human-in-the-loop framework for supervised chromatin domain detection
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