Cell | Cas13高通量筛选细胞关键lncRNA

本文介绍了美国纽约大学Neville E. Sanjana团队利用CRISPR-Cas13技术在5种细胞系中对长非编码RNA（lncRNAs）进行高通量筛选的研究。该研究避免了传统Cas9技术带来的脱靶效应和邻近基因扰动问题，成功筛选出大量对细胞增殖、凋亡和分化至关重要的lncRNAs。研究团队设计了一个包含75000个gRNAs的文库，靶向6199个lncRNAs和4390个蛋白编码基因（PCGs），并通过RNA-seq分析发现约10%的lncRNAs对细胞生存至关重要。研究还鉴定了778个关键lncRNAs，其中大部分具有细胞特异性。此外，研究揭示了lncRNAs与PCGs之间的相互作用，并提出了新的高通量基因筛选方法，为后续研究提供了新的思路。