浙大/华为团队: 3DSMILES-GPT:基于词元化语言模型的3D分子生成

RSC英国皇家化学会 2025-01-08 10:45

文章摘要

本文介绍了浙江大学和华为团队开发的一种新型分子生成框架3DSMILES-GPT，该框架通过将分子的二维和三维结构视为语言表达，利用语言模型实现高效分子生成。研究背景指出，分子生成技术在药物发现中面临多属性优化的挑战。研究目的是开发一种能够同时保证结构合理性和合成可行性的分子生成方法。3DSMILES-GPT通过在大型药物样分子数据集上预训练模型，并在特定蛋白质-配体数据集上进行微调，成功在多项基准指标上表现出色。结论认为，该研究为分子生成方法提供了新的视角，有望在未来的药物设计中发挥重要作用。相关成果已发表在Chemical Science上。

查看文献： 3DSMILES-GPT: 3D molecular pocket-based generation with token-only large language model†
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