​Sci Adv | 新型AI模型揭示与特定大脑细胞类型DNA甲基化相关的遗传变异位点

本文介绍了美国Lieber脑发育研究所开发的一种名为INTERACT的深度学习模型，该模型能够预测特定大脑细胞类型的DNA甲基化（DNAm）调控变异。DNA甲基化是调控大脑发育和功能的重要分子机制，其异常与多种神经和精神疾病密切相关。传统的遗传关联研究依赖于整体组织样本，无法捕捉特定细胞类型的mQTLs，而INTERACT模型通过利用单细胞DNAm数据，显著提高了预测的准确性，并能够识别出驱动DNAm水平的功能变异。研究团队通过整合预测的遗传变异效应，显著提高了精神分裂症、抑郁症和阿尔茨海默病风险位点的精细定位能力，并将潜在致病基因定位至特定细胞类型。这一研究为揭示大脑细胞类型层面的基因调控机制提供了新的视角，并可能为相关疾病的治疗提供新的药物靶点。