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NAR | PPGR: 多年生木本植物遗传信息数据库

林木多组学研究 2025-01-23 09:51
文章摘要
本文介绍了北京林业大学林木分子育种团队与中国科学院北京基因组研究所合作开发的多年生木本植物遗传信息数据库PPGR。该数据库整合了60种木本植物的基因组数据,包括蛋白质-蛋白质互作和转录因子-靶标互作等8.47亿个遗传互作关系对,以及9,016个独立的转录组数据集等。PPGR数据库不仅提供了多组学数据的浏览分析功能,还包含了8个工具模块,支持基因集合的功能富集分析、调控网络分析等。该数据库的建立旨在解析多年生木本植物的重要生物学过程关键基因,建立系统的遗传调控网络,对于阐明该类群植物重要性状的生物学基础、分子育种和种质创新具有重要意义。
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