首页 > 医学

2024年Nature Communications计算生物学亮点论文评述（3）——空间组学算法建模与应用

BioArtMED 2025-02-16 14:30
文章摘要
本文回顾了2024年《自然通讯》杂志中关于空间组学算法建模与应用的亮点论文。文章首先介绍了空间组学技术的发展历程及其在生命科学领域的重要性，随后详细评述了三篇代表性论文。第一篇论文介绍了BIDCell模型，该模型通过整合生物学信息和细胞形态学数据，显著提高了细胞分割的准确性。第二篇论文提出了soScope模型，该模型通过生成式方法提高了空间组学数据的分辨率。第三篇论文介绍了SpaGFT方法，利用图傅里叶变换技术对空间组学数据进行分析，识别空间可变基因并增强低表达基因信号。文章最后总结了空间组学数据分析面临的挑战，并展望了未来的研究方向。
2024年Nature Communications计算生物学亮点论文评述（3）——空间组学算法建模与应用
查看文献： BIDCell: Biologically-informed self-supervised learning for segmentation of subcellular spatial transcriptomics data
查看期刊：Nature Communications
阅读全文
本站注明稿件来源为其他媒体的文/图等稿件均为转载稿，本站转载出于非商业性的教育和科研之目的，并不意味着赞同其观点或证实其内容的真实性。如转载稿涉及版权等问题，请作者速来电或来函联系。
推荐文献
Science Bulletin Science Bulletin
Complex terrain causes global model prediction biases of 21.7 Zhengzhou extreme precipitation
DOI: 10.1016/j.scib.2025.09.015 Pub Date : 2026-01-30
IF 21.1 1区 综合性期刊 Q1
Science Bulletin
iScience iScience
Erratum: Combined HIF-1α blockade and CHIR99021 treatment reverses pulmonary fibrosis via modulation endothelial-to-mesenchymal transition.
DOI: 10.1016/j.isci.2026.114722 Pub Date : 2026-01-22 Date: 2026/2/20 0:00:00
IF 4.1 2区 综合性期刊 Q1
iScience
Nature Communications Nature Communications
Local cloud enhancement associated with urban morphology: evidence from observations and idealized large-eddy simulations
DOI: 10.1038/s41467-026-68986-0 Pub Date : 2026-02-05
IF 16.6 1区 综合性期刊 Q1
Nature Communications
最新文章
生物医学分析全国重点实验室诚聘博士后
生物医学分析全国重点实验室诚聘博士后
更多招聘信息请关注BioArt人才账号BioArt人才生物医学分析全国重点实验室中心简介生物医学分析全国重点实验室，拥有国家创新研究群体、中国科学院院士、国家杰青、国家优青等科技人才队伍。团队先后获得
2025-12-31
Oncogene | 靶向MSLN与B7H3的双靶点CAR-T疗法治疗卵巢癌：协同靶向提升抗肿瘤疗效攻克抗原异质性难题
Oncogene | 靶向MSLN与B7H3的双靶点CAR-T疗法治疗卵巢癌：协同靶向提升抗肿瘤疗效攻克抗原异质性难题
撰文 | 沈杨课题组卵巢癌是一种侵袭性极强的妇科恶性肿瘤，在全球范围内发病率较高。它是导致女性癌症相关死亡的第五大原因，且在所有妇科肿瘤中的死亡率位居首位。尽管治疗手段不断进步，但卵巢癌的标准治疗方案
2025-12-31
J Clin Invest丨发现HGS是一个具备“成药性”的宿主靶点，RTB是一种具有前景的广谱抗冠状病毒候选药物
J Clin Invest丨发现HGS是一个具备“成药性”的宿主靶点，RTB是一种具有前景的广谱抗冠状病毒候选药物
自2019年底爆发以来，新冠（COVID-19）疫情对全球公共卫生构成了严峻挑战。尽管疫苗接种和药物研发在疫情防控中发挥了关键作用，但病毒变异导致的突破性感染仍时有发生，这提示我们需要更深入地理解病毒
2025-12-31
Cell Discovery | 石恒波/王伟/王超尘团队合作揭示大型动物乳腺再生性重塑的关键机制
Cell Discovery | 石恒波/王伟/王超尘团队合作揭示大型动物乳腺再生性重塑的关键机制
组织重塑是发育与再生过程中普遍存在的核心生物学过程，其失衡常导致发育异常、功能受损，并增加疾病风险。在哺乳动物妊娠与泌乳周期中，乳腺经历腺泡扩张、退化等一系列动态重塑过程，该过程对乳腺健康与泌乳性能尤
2025-12-31
BioArtMED
Cell Genomics丨陈迪俊团队和邓润智团队开发一种基于可解释基因程序的单细胞与空间组学数据整合与注释通用分析框架
Cell Genomics丨陈迪俊团队和邓润智团队开发一种基于可解释基因程序的单细胞与空间组学数据整合与注释通用分析框架 2025-12-31
Aging Cell丨唐颢、顾小萍联合揭示YTHDC1通过m6A依赖性支架功能调控端粒酶组装的新机制
Aging Cell丨唐颢、顾小萍联合揭示YTHDC1通过m6A依赖性支架功能调控端粒酶组装的新机制 2025-12-31
J Clin Invest丨何善平/李婷婷等研究揭示mTORC1感知氨基酸的新机制
J Clin Invest丨何善平/李婷婷等研究揭示mTORC1感知氨基酸的新机制 2025-12-31
Cell Discovery | 石恒波/王伟/王超尘团队合作揭示大型动物乳腺再生性重塑的关键机制
Cell Discovery | 石恒波/王伟/王超尘团队合作揭示大型动物乳腺再生性重塑的关键机制 2025-12-31
J Clin Invest丨发现HGS是一个具备“成药性”的宿主靶点，RTB是一种具有前景的广谱抗冠状病毒候选药物
J Clin Invest丨发现HGS是一个具备“成药性”的宿主靶点，RTB是一种具有前景的广谱抗冠状病毒候选药物 2025-12-31
热门类别
综合性期刊 物理 法学 地球科学 历史学
相关文章
重温 | 夏鼐先生的治学之路 Nat Commun |u00A0柏林课题组揭示三萜类抗真菌药物的作用机制 Natureu00A0|u00A0跨血统基因组学研究揭示精神分裂症遗传结构 Adv. Mater. | 超蕃单分子酶研究新进展—光催化高效高选择性产生过氧化氢 陈军院士：有幸为中国地理信息产业协会服务14年
Book学术官方微信
Book学术文献互助
Book学术文献互助群
群 号：604180095
Book学术
文献互助 智能选刊 最新文献 互助须知 联系我们：info@booksci.cn
Book学术提供免费学术资源搜索服务，方便国内外学者检索中英文文献。致力于提供最便捷和优质的服务体验。
Copyright © 2023 Book学术 All rights reserved.
ghs 京公网安备 11010802042870号 京ICP备2023020795号-1