Nat Methods|用于基因组学应用的通用AI模型
智药邦
2025-03-21 08:00
文章摘要
本文介绍了美国InstaDeep公司在Nature Methods上发表的关于通用AI模型在基因组学应用中的研究。研究开发了基于自监督学习的Nucleotide Transformer系列模型,这些模型通过大规模公共基因组数据的预训练,能够提取核苷酸序列的上下文特异性表征,并用于预测分子表型。研究结果表明,这些模型在染色质特征识别、DNA调控元件预测和人类基因组剪接位点识别等任务中表现优异,尤其是在多物种基因组预训练的版本中。尽管存在一些局限性,如处理序列长度限制和跨任务迁移能力不足,但通过未来的多模态模型开发,有望进一步提升模型性能。
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