Cell | 刘梦寒等开发跨物种“基因-生态位”分析框架揭示肠道微生物定殖的保守遗传机制

本研究由哥伦比亚大学Saeed Tavazoie课题组和洛克菲勒大学Sohail Tavazoie实验室合作，旨在揭示肠道微生物定殖的保守遗传机制。研究团队开发了一种跨物种“基因型-生态位”关联框架，通过分析280,000份微生物基因组，识别出79种保守的“定殖因子”（CFs）并将其组织为47个“定殖模块”（CMs）。研究验证了两个翻译相关因子YigZ与TrhP在小鼠肠道定殖中的关键作用，为工程化微生物疗法及肠道菌群调控策略奠定了基础。该研究填补了微生物生态遗传学中“定殖机制”的知识空白，并为未来精准益生治疗提供了方法学基础。